More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3361 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
301 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  56.9 
 
 
310 aa  322  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
301 aa  315  5e-85  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  53.72 
 
 
301 aa  315  7e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  58.78 
 
 
299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  53.02 
 
 
299 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 
323 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  51.51 
 
 
312 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 
306 aa  276  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  50.84 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
301 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
317 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
301 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 
317 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
307 aa  269  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
326 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
309 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  54.05 
 
 
309 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5755  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 
311 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  52.2 
 
 
299 aa  258  7e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 
310 aa  255  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
305 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.83 
 
 
300 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
302 aa  235  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 
312 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0577  LysR family transcriptional regulator  40.94 
 
 
304 aa  222  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 
334 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  41.52 
 
 
310 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  47.16 
 
 
305 aa  215  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  40.83 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
303 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 
303 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
303 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 
344 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
309 aa  204  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
320 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
318 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 
334 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  39.93 
 
 
299 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
301 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 
334 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
334 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
334 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
294 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 
334 aa  198  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  42.49 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 
296 aa  196  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
295 aa  196  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 
302 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  37.37 
 
 
289 aa  196  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 
335 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  35.47 
 
 
302 aa  195  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
297 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
296 aa  196  6e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  38.18 
 
 
297 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  39.19 
 
 
297 aa  195  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.1 
 
 
299 aa  195  9e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
338 aa  195  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 
305 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
302 aa  195  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0873  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
295 aa  194  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
294 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
296 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  38.7 
 
 
310 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.5 
 
 
309 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
294 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
294 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
301 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
296 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 
314 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  38.23 
 
 
314 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
299 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0639  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 
305 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.078735  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
292 aa  189  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 
299 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 
299 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
289 aa  188  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>