More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5755 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5755  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 311 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 301 aa  292  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 299 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  47.6 
 
 		 299 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 305 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 312 aa  255  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 312 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  48.99 
 
 		 301 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 306 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0577  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596869 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 310 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  45.27 
 
 		 301 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 326 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5851  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.905079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 323 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.89 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.49 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 307 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  43.14 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.89 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.18 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  37.91 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 297 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35890  Regulatory protein, LysR family  37.72 
 
 		 309 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  37.87 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 334 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3033  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0273235  normal  0.89504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3691  LysR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  32.08 
 
 		 304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  34.24 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 297 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  33.21 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 297 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 289 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 335 aa  178  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0639  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.078735  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 303 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 294 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3137  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  31.83 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0979  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.039685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 289 aa  175  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>