More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  61.44 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3168  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  55.07 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0639  transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 		 305 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.078735  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  42.67 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  42.67 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 309 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  40.62 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 301 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 299 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 306 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  195  9e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  39.02 
 
 		 318 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 320 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  40.27 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  38.21 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 312 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  37.88 
 
 		 295 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.67 
 
 		 300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  36.7 
 
 		 344 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 307 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 303 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  36.21 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 334 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  38 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 334 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 303 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  40.73 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 334 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  37 
 
 		 301 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 334 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  36.73 
 
 		 300 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4166  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 296 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 316 aa  170  3e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 299 aa  169  5e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  34.59 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 296 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 299 aa  169  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  35.05 
 
 		 315 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 305 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0915  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0209  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  31.4 
 
 		 290 aa  166  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.37 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 334 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0927  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355565  normal  0.387417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>