More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1618 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1618  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 302 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1558  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  55 
 
 		 309 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.525706  hitchhiker  0.00043239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10120  LysR family transcription regulator  55.07 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000385324  normal  0.883998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3168  LysR family transcriptional regulator  53.74 
 
 		 309 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0639  transcriptional regulator, LysR family  56.95 
 
 		 305 aa  321  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.078735  normal  0.279966 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1980  LysR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2905  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.782139  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2818  LysR family substrate binding transcriptional regulator  43.73 
 
 		 303 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.987922  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  43.73 
 
 		 310 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0363  LysR family transcriptional regulator  45.2 
 
 		 307 aa  229  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0111  LysR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.248059  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2030  transcriptional regulator, LysR family  43.25 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4360  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2945  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.71 
 
 		 300 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4156  transcriptional regulator, LysR family  41.46 
 
 		 318 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4228  LysR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 306 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5329  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 301 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0884153  normal  0.0232804 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4957  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.132685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3410  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0692441  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4078  transcriptional regulator, LysR family  44.18 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3662  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6979  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3131  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0530  LysR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 312 aa  215  8e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.546421  normal  0.717973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4379  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 301 aa  215  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0721  LysR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.15311  normal  0.129513 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2363  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.31895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4093  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 344 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3339  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.858524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3287  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150197  normal  0.141874 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3979  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 309 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20844 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3540  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3454  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2594  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.636109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5136  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390119 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3390  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.318019  normal  0.290543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0475  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0415  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  35.86 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0828  LysR family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 303 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 		 314 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.49 
 
 		 305 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  34.14 
 
 		 295 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 294 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2922  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 338 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 334 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  33.9 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4953  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  35.4 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5006  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.238129 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4978  transcriptional regulator, LysR family  43.24 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.486149  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 295 aa  186  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 294 aa  185  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3477  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3150  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  36.04 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3751  transcriptional regulator, LysR family  39.25 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.587681  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  35.79 
 
 		 303 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3565  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 298 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0459  transcriptional regulator, LysR family  39.06 
 
 		 297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1480  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 294 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191498 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 303 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4490  LysR substrate-binding  39.13 
 
 		 301 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3361  transcriptional regulator, LysR family  43 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3324  LysR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0124664  normal  0.140943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>