More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1549 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 247 aa  477  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  51.81 
 
 		 280 aa  261  8.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  56.38 
 
 		 250 aa  258  6e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 256 aa  225  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  46.56 
 
 		 256 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 255 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 254 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 261 aa  205  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  44.13 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  45.06 
 
 		 274 aa  201  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 264 aa  198  7.999999999999999e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 		 255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  40.65 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 256 aa  164  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  41.13 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 250 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  40.33 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  39.29 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  42.15 
 
 		 249 aa  159  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  39.02 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  35.69 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  35.69 
 
 		 253 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  35.12 
 
 		 241 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  35.59 
 
 		 298 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  35.08 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  35.29 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  35.83 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0237  triosephosphate isomerase  33.07 
 
 		 259 aa  152  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.4 
 
 		 646 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 254 aa  151  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0891  triosephosphate isomerase  38.76 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.427373  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  38.68 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  39.18 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  35.29 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  35.51 
 
 		 650 aa  150  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  35.55 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0742  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 256 aa  148  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 655 aa  148  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  41.98 
 
 		 257 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  37.05 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  36.75 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  39.44 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  39.37 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  37.5 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  36.21 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  35.97 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  38.34 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  35.2 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  36.55 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  39.6 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  39.34 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  34.52 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  37.34 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  41.2 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  34.02 
 
 		 241 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  39.29 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  37.55 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0012  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  38.82 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  35.97 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  32.94 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  36.44 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  39.04 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3369  Triose-phosphate isomerase  36.91 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0061573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  32.41 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  40.33 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  38.78 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  35.06 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  32.54 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1172  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.162207  normal  0.323144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  39.43 
 
 		 256 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  32.14 
 
 		 253 aa  141  9e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  34.82 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  38.71 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  34.52 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  38.87 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  37.75 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  38.35 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5606  triosephosphate isomerase  38.37 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245433  normal  0.85925 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  34.8 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  36.93 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  35.04 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  34.39 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  38.06 
 
 		 263 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  38.65 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>