More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4651 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  69.08 
 
 		 256 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  74 
 
 		 255 aa  361  7.0000000000000005e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  69.88 
 
 		 256 aa  359  2e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  69.2 
 
 		 256 aa  357  9e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  68.8 
 
 		 256 aa  355  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  65.2 
 
 		 260 aa  350  2e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  45.56 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 258 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  45.05 
 
 		 280 aa  216  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 		 261 aa  214  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  47.74 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 247 aa  201  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  42.51 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  43.53 
 
 		 248 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  40.71 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  43.48 
 
 		 243 aa  188  8e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  41.73 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  43.62 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  41.81 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  41.81 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 251 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  39.75 
 
 		 246 aa  184  9e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 250 aa  184  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  43.23 
 
 		 655 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  37.8 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  39.52 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  41.2 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  37.3 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  41.18 
 
 		 250 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  39.53 
 
 		 265 aa  179  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 253 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  41.56 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  42.47 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  40.41 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  41.34 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  39.43 
 
 		 250 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  38.8 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  42.08 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  40.49 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  39.92 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 230 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  39.02 
 
 		 243 aa  171  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  40.65 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  42.8 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  41.74 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  41.25 
 
 		 646 aa  168  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40 
 
 		 650 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  37.75 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  39.09 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  42.31 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  40.65 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  37.8 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  36.82 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  39.59 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  38.27 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  41.22 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  39.91 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  36.4 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.01 
 
 		 654 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  41 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  36.64 
 
 		 241 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  39.52 
 
 		 253 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  42.24 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  36.84 
 
 		 254 aa  161  8.000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  39.02 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  36.36 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  38.71 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  41.41 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  37.14 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  37.75 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>