More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0988 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 274 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  89.02 
 
 		 264 aa  494  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  74.61 
 
 		 261 aa  397  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 256 aa  229  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  47.64 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  47.24 
 
 		 256 aa  227  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 254 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 260 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 256 aa  215  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 250 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 248 aa  208  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.4 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 250 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  41.58 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 251 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  40.39 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  37.89 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  40.94 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 250 aa  196  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.04 
 
 		 650 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  38.58 
 
 		 253 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  39.92 
 
 		 250 aa  192  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  40.55 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  39.53 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.22 
 
 		 655 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.37 
 
 		 646 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  38.19 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  39 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  39.44 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  39.06 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 		 248 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13130  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 263 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.751982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 261 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  39.22 
 
 		 251 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 252 aa  184  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 308 aa  184  9e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  38.8 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  37.01 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  35.55 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  37.01 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 250 aa  183  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  38.43 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  39.22 
 
 		 246 aa  182  6e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  38.22 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  40.71 
 
 		 256 aa  182  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15220  triosephosphate isomerase  36.44 
 
 		 258 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.005965  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  36.86 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  38.43 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 256 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  39.52 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  38.52 
 
 		 261 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  36.47 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  36.22 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  37 
 
 		 287 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  38.58 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2015  triosephosphate isomerase  36.76 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.944897  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  38.74 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  37.35 
 
 		 258 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  37.8 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  38.98 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  37.8 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1258  triosephosphate isomerase  37.94 
 
 		 260 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.352341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1941  triosephosphate isomerase  37.05 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.36983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  38.67 
 
 		 249 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.9 
 
 		 687 aa  175  9e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  38.43 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  38.04 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0433  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.292554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  40.47 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>