More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2906 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  100 
 
 
256 aa  525  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  94.53 
 
 
256 aa  501  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  94.14 
 
 
256 aa  500  1e-140  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  82.07 
 
 
256 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  77.56 
 
 
260 aa  417  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  71.83 
 
 
255 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  69.88 
 
 
254 aa  359  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  46.9 
 
 
264 aa  238  6.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  46.93 
 
 
280 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 
274 aa  229  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 
261 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  46.92 
 
 
258 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  49.38 
 
 
250 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 
247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.87 
 
 
250 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  41.8 
 
 
250 aa  198  6e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  38.74 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 
255 aa  192  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 
251 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 
250 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  41.8 
 
 
251 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44 
 
 
251 aa  187  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 
249 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 
253 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42 
 
 
250 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 
253 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 
253 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  41.7 
 
 
249 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 
241 aa  185  8e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  40.87 
 
 
257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  39.22 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  41.22 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  38.17 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  42.67 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  42.67 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 
254 aa  181  7e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  43.44 
 
 
251 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  42 
 
 
251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  40.71 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 
251 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  41.37 
 
 
251 aa  178  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  38.8 
 
 
250 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  40 
 
 
254 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 
251 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  41.6 
 
 
251 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.16 
 
 
650 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41 
 
 
248 aa  175  5e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 
249 aa  175  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  42.04 
 
 
646 aa  175  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  40.96 
 
 
251 aa  175  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 
255 aa  175  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.83 
 
 
655 aa  175  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  41.06 
 
 
243 aa  174  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  43.42 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  40.87 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  42.31 
 
 
243 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  38.55 
 
 
250 aa  172  5e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  41.73 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  39.29 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  39.29 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  40 
 
 
254 aa  172  6.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 
253 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  38.87 
 
 
246 aa  171  1e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  40 
 
 
241 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  37.4 
 
 
298 aa  170  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  39.83 
 
 
230 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  39.83 
 
 
230 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 
253 aa  170  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  38.71 
 
 
252 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  42.28 
 
 
246 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  39.6 
 
 
252 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  38.62 
 
 
263 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  39.61 
 
 
257 aa  166  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  38.31 
 
 
250 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  37.75 
 
 
250 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  40.89 
 
 
252 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  37.75 
 
 
250 aa  166  4e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  39.11 
 
 
250 aa  166  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  40.8 
 
 
253 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 
252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 
251 aa  165  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09381  triosephosphate isomerase  35.6 
 
 
243 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670344 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  36.8 
 
 
250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 
251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  36.51 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 
252 aa  162  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  40.16 
 
 
254 aa  162  7e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 
249 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  37.7 
 
 
256 aa  161  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  38.04 
 
 
257 aa  161  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0348  Triose-phosphate isomerase  40.4 
 
 
251 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0212974 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  38.82 
 
 
253 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>