More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1358 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 258 aa  511  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  46.92 
 
 		 256 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  47.77 
 
 		 254 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  46.06 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  47.01 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 256 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  47.35 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 250 aa  208  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  43.12 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.63 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  40.64 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.12 
 
 		 250 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  188  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  46.37 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  41.22 
 
 		 251 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  37.1 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  39.6 
 
 		 251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  42.02 
 
 		 255 aa  181  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  41.77 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.27 
 
 		 655 aa  178  5.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 251 aa  174  9e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  42.39 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  38.1 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  38.87 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  41.37 
 
 		 256 aa  171  6.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  42.63 
 
 		 253 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  38.19 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  35.6 
 
 		 270 aa  171  2e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  42.32 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  43.97 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  40.43 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  40 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  36.07 
 
 		 246 aa  169  5e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  38.84 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  37.45 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1410  Triose-phosphate isomerase  44 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  41.87 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  36.29 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  37.7 
 
 		 650 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  40.49 
 
 		 250 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  40.79 
 
 		 243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  39.83 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  36.65 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  41.49 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 261 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1176  Triose-phosphate isomerase  43.14 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  38.78 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  37.05 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  37.3 
 
 		 241 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  37.96 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  41.25 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  38.78 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  36.14 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  37.14 
 
 		 298 aa  159  3e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  36.48 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  36.48 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  36.33 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  37.1 
 
 		 253 aa  159  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  37.34 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2060  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183985  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  37.55 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  36.56 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  39.22 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  42.91 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  40.41 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  39.36 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3369  Triose-phosphate isomerase  39.83 
 
 		 231 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0061573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3277  triosephosphate isomerase  38.21 
 
 		 251 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000689826  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  38.55 
 
 		 261 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4528  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  39.74 
 
 		 230 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1520  triosephosphate isomerase  39.2 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  39.67 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  36.73 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  36.29 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  36.29 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  38.37 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  36.82 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  38.66 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  38.67 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>