More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5328 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 256 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  82.07 
 
 		 256 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  81.67 
 
 		 256 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  82.07 
 
 		 256 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  72.44 
 
 		 260 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  69.08 
 
 		 254 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  73.2 
 
 		 255 aa  359  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  45.79 
 
 		 280 aa  224  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 261 aa  221  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  44.57 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  44.76 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  45.68 
 
 		 250 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  37.74 
 
 		 270 aa  188  8e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  40.16 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  42.35 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  41.43 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  42.62 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  39.59 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  42.34 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  42 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  37.14 
 
 		 249 aa  178  5.999999999999999e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.08 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_649  triose-phosphate isomerase  39.92 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  38.1 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  40.09 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  40.09 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.47 
 
 		 646 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  40.41 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  40.41 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  39.42 
 
 		 655 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  37.65 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  42.21 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 251 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  40.82 
 
 		 251 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  37.8 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  38.3 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  41.49 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  38.8 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1380  triosephosphate isomerase  37.08 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  40 
 
 		 256 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 253 aa  168  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 250 aa  168  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0274  Triose-phosphate isomerase  38.1 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  38.89 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  39.26 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  37.96 
 
 		 243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  38.65 
 
 		 254 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  43.1 
 
 		 246 aa  166  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  40.24 
 
 		 249 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  39.13 
 
 		 249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 252 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  37.3 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1078  triosephosphate isomerase  35.41 
 
 		 298 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  38.46 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  37.25 
 
 		 250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  39.42 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  36.76 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  36.48 
 
 		 650 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1628  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40 
 
 		 654 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00657054  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  38.19 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1261  triosephosphate isomerase  37.1 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  38.49 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  38.96 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3290  triosephosphate isomerase  37.18 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2499  triosephosphate isomerase  36.71 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3615  Triose-phosphate isomerase  36.71 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4008  triosephosphate isomerase  33.74 
 
 		 241 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0608629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1532  triosephosphate isomerase  38.15 
 
 		 253 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.743336  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  39.84 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  36.11 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  37.35 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  36.44 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  37.5 
 
 		 252 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  38.37 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  37.39 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  36.29 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2423  triosephosphate isomerase  39.36 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00789739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2335  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 253 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.549293  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  37.86 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  35.97 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  37.19 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  37.4 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  38.24 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  35.39 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  36.55 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>