More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2155 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2155  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.704147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0752  triosephosphate isomerase  76.17 
 
 		 264 aa  409  1e-113  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0988  triosephosphate isomerase  74.61 
 
 		 274 aa  397  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0816  triosephosphate isomerase  48.45 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.992949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0869  triosephosphate isomerase  48.06 
 
 		 256 aa  231  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2906  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5328  triosephosphate isomerase  48.77 
 
 		 256 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.619537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3113  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0355095  hitchhiker  0.000111985 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1358  triosephosphate isomerase  47.98 
 
 		 258 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.303636  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2150  triosephosphate isomerase  47.84 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4651  triosephosphate isomerase  46.3 
 
 		 254 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743996  normal  0.314154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28670  triosephosphate isomerase  45.35 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.887125  normal  0.0357824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1549  triosephosphate isomerase  45.7 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.411882  normal  0.289176 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  44.23 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.98 
 
 		 650 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  40.87 
 
 		 655 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 248 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 254 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  41.34 
 
 		 250 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  39.52 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  41.9 
 
 		 254 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00520  triosephosphate isomerase  41.22 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  42.32 
 
 		 243 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  40.94 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  42.32 
 
 		 243 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0922  triosephosphate isomerase  37.25 
 
 		 255 aa  188  8e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.282683 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 246 aa  188  9e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  38.04 
 
 		 251 aa  188  9e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3096  Triose-phosphate isomerase  42.8 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119937  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  39.52 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  39.22 
 
 		 250 aa  186  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0056  triosephosphate isomerase  37.89 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  41.11 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3323  Triose-phosphate isomerase  42.8 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000945528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 249 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  39.92 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  38.52 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1153  triosephosphate isomerase  38.87 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0738  Triose-phosphate isomerase  40.5 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000147069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4929  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000863193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4816  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4826  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000474663  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  37.94 
 
 		 252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1264  Triose-phosphate isomerase  40.42 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0799  triosephosphate isomerase  35.94 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.522052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0815  triosephosphate isomerase  35.94 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0604  triosephosphate isomerase  37.4 
 
 		 270 aa  178  8e-44  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.783409  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4987  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0363802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5366  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  178  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000572833  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5240  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  178  9e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0117313  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0763  triosephosphate isomerase  37.6 
 
 		 252 aa  178  9e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0077962  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5286  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  38.15 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5222  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  177  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  37.7 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  38.91 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2365  triosephosphate isomerase  40.39 
 
 		 262 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  37.2 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  37.85 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.1 
 
 		 646 aa  175  8e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  38.52 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  39.76 
 
 		 253 aa  174  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  35.74 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  38.25 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  39.6 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0444  triosephosphate isomerase  35.8 
 
 		 253 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  34.65 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  38.82 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1115  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  38.4 
 
 		 687 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0990546  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  41.04 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  36.61 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  37.16 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  38.19 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  38.58 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  36.65 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1236  triosephosphate isomerase  38.34 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000124491  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2017  triosephosphate isomerase  33.86 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.283793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  37.05 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3708  triosephosphate isomerase  38.04 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  37.94 
 
 		 250 aa  169  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  37.25 
 
 		 254 aa  169  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1695  triosephosphate isomerase  37.15 
 
 		 251 aa  168  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00252562  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  36.51 
 
 		 275 aa  168  8e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  36.65 
 
 		 249 aa  168  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2048  triosephosphate isomerase  37.36 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0742  triosephosphate isomerase  39.85 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0151  Triose-phosphate isomerase  35.46 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1948  triosephosphate isomerase  35.16 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000540949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2538  triosephosphate isomerase  37.65 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00272657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  36 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  35.04 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>