More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1967 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1967  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4199  ATPase central domain-containing protein  69.8 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4856  AAA ATPase central domain protein  43.3 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4495  AAA ATPase, central region  38.41 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6750  ATPase central domain-containing protein  37.38 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2370  AAA+ class ATPase  35.62 
 
 		 315 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4406  AAA ATPase, central region  37.58 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0124  AAA ATPase  38.41 
 
 		 303 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0342  AAA ATPase central domain protein  31.67 
 
 		 781 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10191  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04270)  32.24 
 
 		 1631 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.81 
 
 		 763 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16611  predicted protein  26.72 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  27.86 
 
 		 703 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.16 
 
 		 704 aa  62.4  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  29.67 
 
 		 425 aa  62.4  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  28.72 
 
 		 787 aa  62.4  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  24.75 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  28.44 
 
 		 757 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.68 
 
 		 772 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.62 
 
 		 742 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  33.74 
 
 		 788 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.91 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  31.08 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.15 
 
 		 718 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  30.81 
 
 		 422 aa  60.8  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  29.22 
 
 		 697 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  29.76 
 
 		 357 aa  60.1  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.52 
 
 		 754 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  30.32 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  33.11 
 
 		 682 aa  59.7  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  27.31 
 
 		 727 aa  59.7  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.25 
 
 		 754 aa  59.3  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.82 
 
 		 755 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 		 744 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  28.95 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  28.21 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  30.12 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0937  proteasome-activating nucleotidase  28.5 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.274692  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  27.57 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.86 
 
 		 740 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  30.43 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  28.43 
 
 		 477 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  31.79 
 
 		 599 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  31.55 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0801  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.49 
 
 		 806 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.704818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  26.35 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.68 
 
 		 773 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  30.48 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0185  proteasome-activating nucleotidase  27.36 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.24 
 
 		 742 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0368  proteasome-activating nucleotidase  28.74 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.103097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.05 
 
 		 738 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  27.27 
 
 		 327 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90881  AAA+-type ATPase  31.06 
 
 		 788 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.369927 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2321  AAA ATPase central domain protein  26.79 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3585300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2078  cell division cycle protein  29.7 
 
 		 763 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0596077  normal  0.822776 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0274  AAA family ATPase  27.47 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342467 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  31.37 
 
 		 795 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.89 
 
 		 740 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  27.43 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.33 
 
 		 754 aa  56.6  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  25.31 
 
 		 371 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  27.44 
 
 		 468 aa  56.2  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  31.37 
 
 		 743 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  30.13 
 
 		 756 aa  56.2  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  31.58 
 
 		 448 aa  55.8  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  29.19 
 
 		 478 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.09 
 
 		 743 aa  55.8  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.03 
 
 		 753 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.68 
 
 		 757 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  29.17 
 
 		 729 aa  55.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  27.87 
 
 		 348 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  32.68 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.47 
 
 		 804 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  29.61 
 
 		 697 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2253  Microtubule-severing ATPase  31.11 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.951648  normal  0.563055 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  28.32 
 
 		 930 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  31.33 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  27.27 
 
 		 806 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  32.1 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  25.31 
 
 		 371 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  29.8 
 
 		 703 aa  54.7  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  29.33 
 
 		 699 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3406  AAA ATPase, central region  32.11 
 
 		 445 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.397365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.09 
 
 		 808 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  26.59 
 
 		 430 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33894  predicted protein  26.6 
 
 		 398 aa  54.3  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00183921  normal  0.0445175 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  28.94 
 
 		 662 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0721  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.14 
 
 		 756 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.117729  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2902  proteasome-activating nucleotidase  27.54 
 
 		 404 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.857488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  28.48 
 
 		 725 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  30.6 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  30.52 
 
 		 657 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  33.33 
 
 		 789 aa  54.7  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3121  Microtubule-severing ATPase  30.63 
 
 		 493 aa  53.9  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  29.68 
 
 		 432 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  28.8 
 
 		 388 aa  53.9  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>