148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4406 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4406  AAA ATPase, central region  100 
 
 
315 aa  630  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.707612  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4495  AAA ATPase, central region  90.48 
 
 
315 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6750  ATPase central domain-containing protein  76.95 
 
 
311 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2370  AAA+ class ATPase  70.16 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0124  AAA ATPase  47.4 
 
 
303 aa  255  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4856  AAA ATPase central domain protein  34.65 
 
 
294 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1967  ATPase central domain-containing protein  37.58 
 
 
298 aa  175  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4199  ATPase central domain-containing protein  36.67 
 
 
299 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  23.01 
 
 
371 aa  63.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  30.04 
 
 
756 aa  60.5  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  24.4 
 
 
371 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  22.89 
 
 
371 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  26.59 
 
 
419 aa  57.4  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  24 
 
 
371 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  27.71 
 
 
348 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  23.01 
 
 
388 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1787  AAA ATPase family protein  23.94 
 
 
372 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  25.81 
 
 
425 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  22.37 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.03 
 
 
424 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  25.12 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04040  ATPase, putative  29.29 
 
 
370 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  28.57 
 
 
335 aa  52.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  23.28 
 
 
648 aa  52.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3406  AAA ATPase, central region  31.55 
 
 
445 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.397365  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0698  ATPase central domain-containing protein  22.57 
 
 
385 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.24522  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1259  AAA ATPase central domain protein  27.87 
 
 
573 aa  52  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.636785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  24.77 
 
 
477 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  32.05 
 
 
789 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  25.11 
 
 
321 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  27.56 
 
 
697 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  26.57 
 
 
427 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  30.36 
 
 
771 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  33.11 
 
 
775 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  32.3 
 
 
789 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  25.37 
 
 
428 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  30.48 
 
 
412 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4143  ATPase central domain-containing protein  27.96 
 
 
243 aa  50.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.802818  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  25.99 
 
 
832 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  29.68 
 
 
662 aa  49.7  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  33.13 
 
 
956 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  25.24 
 
 
624 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1358  cell division protein FtsH3  25.24 
 
 
620 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  25.24 
 
 
620 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  23.78 
 
 
391 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  23.71 
 
 
641 aa  49.7  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  26.92 
 
 
697 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  32.72 
 
 
772 aa  49.3  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  28.93 
 
 
419 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6929  AAA ATPase central domain protein  29.41 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00438766  hitchhiker  0.00101304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  26.34 
 
 
425 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  29.87 
 
 
665 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26133  AAA-metalloprotease FtsH, chloroplast precursor  27.03 
 
 
677 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313854  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  29.81 
 
 
766 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  30.72 
 
 
773 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  29.19 
 
 
771 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  27.95 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9309  predicted protein  28 
 
 
284 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00065692  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  27.62 
 
 
671 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  24.11 
 
 
620 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  27.61 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  24.47 
 
 
619 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  28.66 
 
 
795 aa  48.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.71 
 
 
730 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16831  cell division protein FtsH3  24.27 
 
 
635 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0634  ATPase central domain-containing protein  27.17 
 
 
599 aa  47.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.527117  normal  0.730431 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  30.07 
 
 
773 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  25.09 
 
 
610 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  27.76 
 
 
332 aa  47.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44478  predicted protein  31.25 
 
 
549 aa  47.4  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19161  cell division protein FtsH3  24.27 
 
 
625 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.134422 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  27.62 
 
 
328 aa  47  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  37.18 
 
 
308 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41501  predicted protein  25.71 
 
 
449 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364066  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14251  cell division protein FtsH3  24.76 
 
 
620 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.520813  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2457  ATP-dependent metalloprotease FtsH  26.61 
 
 
615 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133798  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  25.3 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  25.3 
 
 
327 aa  46.2  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9090  predicted protein  30.29 
 
 
431 aa  46.6  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  26.6 
 
 
410 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.02 
 
 
625 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3438  ATP-dependent metalloprotease FtsH  24.37 
 
 
607 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.588898  hitchhiker  0.000161563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  28.57 
 
 
369 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33873  40 kDa putative membrane-spanning ATPase  26.51 
 
 
357 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.767325  normal  0.0397668 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0266  ATPase central domain-containing protein  21.67 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.614656  hitchhiker  0.00000478059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  29.03 
 
 
450 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  26.61 
 
 
657 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01366  AAA family ATPase/60S ribosome export protein Rix7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09210)  27.84 
 
 
729 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690514  normal  0.790284 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  26.63 
 
 
607 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1798  ATP-dependent metalloprotease FtsH  24.55 
 
 
635 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62860  cell division protein FtsH  26.15 
 
 
639 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  26.15 
 
 
642 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2321  AAA ATPase central domain protein  24.83 
 
 
305 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3585300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  27.74 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1798  ATP-dependent M41 family peptidase  25.76 
 
 
1284 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5669  AAA ATPase central domain protein  32.62 
 
 
699 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.658199  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  30.23 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  26.61 
 
 
335 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1347  putative cell division protein FtsH-like protein  29.45 
 
 
643 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  27.74 
 
 
355 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>