More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0266 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0266  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 277 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.614656  hitchhiker  0.00000478059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2321  AAA ATPase central domain protein  32.34 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3585300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  32.03 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2570  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.64 
 
 		 754 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2377  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.21 
 
 		 754 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0911184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.89 
 
 		 754 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0774  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.17 
 
 		 763 aa  73.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0186  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  34.19 
 
 		 754 aa  73.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.735425  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2088  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.73 
 
 		 757 aa  71.6  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  31.43 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2618  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  31.55 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.91 
 
 		 701 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  30 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  27.85 
 
 		 655 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0101  AAA family ATPase  27.04 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2157  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.23 
 
 		 805 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  32.12 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2069  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 		 776 aa  67.4  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.963415  normal  0.166628 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  29.6 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  28.57 
 
 		 739 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.85 
 
 		 721 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  26.07 
 
 		 756 aa  67  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1184  vesicle-fusing ATPase  28 
 
 		 583 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.89835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.4 
 
 		 808 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2036  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.33 
 
 		 738 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2237  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.77 
 
 		 760 aa  66.2  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.714919  hitchhiker  0.00116509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  30.73 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.84 
 
 		 493 aa  65.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  30 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.9 
 
 		 753 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  30.28 
 
 		 367 aa  65.5  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0697  AAA ATPase, CDC48  27.81 
 
 		 718 aa  65.5  0.0000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  29.24 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2231  AAA ATPase central domain protein  28.79 
 
 		 599 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.377087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3020  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  33.8 
 
 		 709 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  28.57 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1716  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.34 
 
 		 740 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_769  predicted protein  26.77 
 
 		 550 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  28.57 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.48 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1810  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.63 
 
 		 715 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0077  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.77 
 
 		 739 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.48 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 826 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  31.52 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2344  Vesicle-fusing ATPase  31.47 
 
 		 703 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.935246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  24.66 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1677  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.99 
 
 		 736 aa  63.5  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0011  AAA family ATPase  27.04 
 
 		 713 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1253  ATPase of the AAA+ class  34.29 
 
 		 348 aa  63.9  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.228629  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  24.66 
 
 		 575 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0867  proteasome-activating nucleotidase  25.43 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.199281  normal  0.0151046 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1156  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.53 
 
 		 769 aa  63.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.14 
 
 		 723 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1838  AAA ATPase central domain-containing protein  27.37 
 
 		 587 aa  63.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2178  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  25.37 
 
 		 743 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1780  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.98 
 
 		 740 aa  63.5  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.363046  normal  0.250339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0531  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.32 
 
 		 719 aa  63.2  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.06 
 
 		 718 aa  63.2  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0817  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.57 
 
 		 801 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  28.67 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  26.63 
 
 		 434 aa  62.8  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  28.08 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3132  vesicle-fusing ATPase  27.69 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.594904  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  31.06 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0210  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.01 
 
 		 768 aa  62.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.798334  normal  0.0460927 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1201  AAA ATPase central domain protein  27.57 
 
 		 550 aa  62.8  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.226586  normal  0.53529 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3144  vesicle-fusing ATPase  27.69 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.844624 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3194  vesicle-fusing ATPase  27.69 
 
 		 615 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176841  normal  0.0401396 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.01 
 
 		 759 aa  62.4  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2975  AAA ATPase central domain protein  29 
 
 		 592 aa  62.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00499196  normal  0.0176892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  29.25 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  26.53 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  26.63 
 
 		 742 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22080  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  29.35 
 
 		 602 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  27.18 
 
 		 468 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.81 
 
 		 784 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0775  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.62 
 
 		 781 aa  62  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07047  membrane-spanning ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03990)  25.74 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.186153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0001  Vesicle-fusing ATPase  28.29 
 
 		 699 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1176  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.88 
 
 		 800 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  26.82 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2678  AAA ATPase central domain protein  28 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.191022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2451  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.24 
 
 		 804 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.530015 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0541  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.01 
 
 		 735 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.716512  normal  0.437699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3069  vesicle-fusing ATPase  27.37 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291044  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5798  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  25.9 
 
 		 755 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.256428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2307  AAA ATPase central domain protein  26.6 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000305444  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30 
 
 		 781 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3458  vesicle-fusing ATPase  27.37 
 
 		 615 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2423  AAA ATPase central domain protein  30.19 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  25.31 
 
 		 703 aa  61.6  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  30.43 
 
 		 371 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  31.06 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2321  cell division control protein 48 AAA family protein  31.16 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  26.57 
 
 		 641 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  27.5 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2358  ATPase central domain-containing protein  27.89 
 
 		 593 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.164365 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1971  ATP-dependent 26S proteasome regulatory subunit  27.47 
 
 		 521 aa  60.8  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>