More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44478 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_44478  predicted protein  100 
 
 
549 aa  1124    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16611  predicted protein  39.75 
 
 
589 aa  353  4e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  30.89 
 
 
317 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  29.44 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  28.5 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  28.5 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2049  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.25 
 
 
577 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000035713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.55 
 
 
721 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06263  mitochondrial AAA ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12920)  28.85 
 
 
956 aa  76.6  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137043  normal  0.111453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  25.71 
 
 
335 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  28.57 
 
 
371 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  33.16 
 
 
332 aa  75.9  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30513  predicted protein  28.91 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.436051  normal  0.665929 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.33 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  30.22 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07254  Cell division control protein 48 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AWS6]  25.26 
 
 
814 aa  74.3  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.385633  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1197  ATPase central domain-containing protein  30.32 
 
 
371 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.862014  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  26.46 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  30.05 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0225  Microtubule-severing ATPase  28.64 
 
 
607 aa  73.9  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.757566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  28.43 
 
 
371 aa  73.6  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03691  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12560)  30.29 
 
 
803 aa  73.2  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1023  peptidase M41  30.2 
 
 
547 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_6399  predicted protein  27.93 
 
 
290 aa  73.6  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.458224  normal  0.109876 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  25.26 
 
 
810 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32343  predicted protein  28.95 
 
 
425 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0415891  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4465  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.35 
 
 
610 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03061  vacuolar sorting ATPase Vps4, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09360)  27.84 
 
 
434 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.548011  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1654  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.35 
 
 
652 aa  71.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  32.34 
 
 
328 aa  72  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  34.27 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  32.2 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4825  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.9 
 
 
610 aa  71.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.185194  normal  0.513387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2600  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.28 
 
 
641 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00460  ATPase, putative  26.94 
 
 
439 aa  71.2  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  32.93 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.12 
 
 
666 aa  71.2  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0625  methyltransferase type 11  26.98 
 
 
826 aa  71.2  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1305  proteasome-activating nucleotidase  25.21 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.53 
 
 
638 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  26.74 
 
 
325 aa  70.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67138  Cell division control protein 48  24.74 
 
 
829 aa  70.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0876334 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0613  cell division protein, ATP-dependent metalloprotease  30.1 
 
 
692 aa  70.9  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0128  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.9 
 
 
614 aa  70.9  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.464101 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  24.88 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  27.45 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  32.96 
 
 
348 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0309  AAA ATPase  33.55 
 
 
415 aa  70.5  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.902003  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  32.93 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  31.74 
 
 
328 aa  70.1  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30898  vacuolar protein  27.41 
 
 
422 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  26.8 
 
 
718 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  27.32 
 
 
806 aa  69.7  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  31.14 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  29.29 
 
 
658 aa  68.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl672  cell division protein  29.41 
 
 
650 aa  69.3  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06980  helicase, putative  28.79 
 
 
756 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0189232  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1384  26S proteasome subunit P45 family  26.67 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0469863  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01640  ATPase, putative  26.6 
 
 
1159 aa  69.3  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.65 
 
 
662 aa  69.3  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  27.04 
 
 
631 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1061  peptidase M41, FtsH  30.65 
 
 
642 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498037  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13071  cell division protein FtsH3  27.67 
 
 
619 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.208154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4814  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.43 
 
 
625 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.726318 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1160  proteasome-activating nucleotidase  25.99 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0573  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.55 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  31.14 
 
 
329 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.31 
 
 
659 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_002950  PG0047  cell division protein FtsH, putative  26.75 
 
 
673 aa  68.6  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1253  cell division protein FtsH  29.08 
 
 
613 aa  68.6  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.05 
 
 
676 aa  68.2  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  31.74 
 
 
333 aa  68.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.15 
 
 
669 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.13 
 
 
781 aa  68.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.06 
 
 
659 aa  68.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000208375  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  28.87 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  25.77 
 
 
804 aa  68.6  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.15 
 
 
671 aa  68.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5040  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.93 
 
 
685 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  26.29 
 
 
754 aa  68.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  29.55 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1606  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.21 
 
 
773 aa  68.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.168179  normal  0.400051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.5 
 
 
640 aa  67.8  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0470  vesicle-fusing ATPase  27.27 
 
 
703 aa  67.8  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10524  predicted protein  31.86 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_50978  predicted protein  24.88 
 
 
930 aa  67.8  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02917  hypothetical protein similar to 26S proteasome regulatory subunit (Broad)  28.36 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.137848 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  30.46 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75017  protease subunit component  28.36 
 
 
446 aa  67.4  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0564069 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1362  26S proteasome subunit P45 family  27.19 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  30.46 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0078  microtubule-severing ATPase  26.52 
 
 
490 aa  67.4  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1594  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29.87 
 
 
730 aa  67.4  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0267229  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0076  membrane protease FtsH catalytic subunit  29.53 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.597348  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1499  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  27.39 
 
 
784 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08031  FtsH ATP-dependent protease-like protein  29.9 
 
 
637 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2011  proteasome-activating nucleotidase  28.57 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.705003  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0614  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.39 
 
 
628 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14631  cell division protein FtsH3  27.18 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.336719  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14491  cell division protein FtsH3  27.18 
 
 
620 aa  67.4  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>