More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0329 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0329  transcriptional regulator  100 
 
 		 131 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447669  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0841  transcriptional regulator  96.18 
 
 		 131 aa  227  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127353  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1131  putative HTH-type transcriptional regulator yafC  96.18 
 
 		 131 aa  227  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1765  LysR family transcriptional regulator  97.35 
 
 		 186 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0420  transcriptional regulator  85.05 
 
 		 343 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2155  LysR family transcriptional regulator  85.05 
 
 		 308 aa  188  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5294  LysR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 314 aa  168  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4749  LysR family transcriptional regulator  74.77 
 
 		 314 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5408  LysR family transcriptional regulator  82.61 
 
 		 314 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5454  LysR family transcriptional regulator  82.61 
 
 		 314 aa  167  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  82.61 
 
 		 313 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3353  LysR family transcriptional regulator  80.65 
 
 		 315 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0979996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0241  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 313 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5574  LysR family transcriptional regulator  76.67 
 
 		 300 aa  156  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5365  putative LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 300 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  68.54 
 
 		 298 aa  134  5e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  67.42 
 
 		 298 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5117  LysR family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 300 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0285  LysR family transcriptional regulator  62.22 
 
 		 298 aa  128  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3897  transcriptional regulator, LysR family  65.56 
 
 		 300 aa  126  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4672  LysR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 300 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4262  LysR family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 298 aa  124  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.932976  decreased coverage  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6075  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 300 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5711  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 300 aa  124  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6559  LysR family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 300 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.379157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  59.55 
 
 		 298 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  64.04 
 
 		 297 aa  121  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 298 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 298 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 313 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 303 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  60 
 
 		 327 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  57.3 
 
 		 298 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  55.06 
 
 		 298 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0579  LysR family substrate binding transcriptional regulator  56.04 
 
 		 303 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0660  LysR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 303 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 298 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  57.61 
 
 		 293 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  60 
 
 		 295 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0278  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  56.04 
 
 		 303 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0067  LysR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 302 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 299 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  56.18 
 
 		 298 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  53.26 
 
 		 298 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 293 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 293 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4004  LysR family transcriptional regulator  57.3 
 
 		 295 aa  110  9e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  55.06 
 
 		 298 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  52.81 
 
 		 293 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  46 
 
 		 304 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46 
 
 		 304 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  46 
 
 		 304 aa  102  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 304 aa  102  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 304 aa  102  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2800  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 291 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111359  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 304 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  45 
 
 		 304 aa  101  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  47.87 
 
 		 304 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 304 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0944  LysR family transcriptional regulator  51.69 
 
 		 297 aa  97.1  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  48.91 
 
 		 299 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 300 aa  94.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  43 
 
 		 304 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  43 
 
 		 304 aa  93.6  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 304 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  41.67 
 
 		 304 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  43 
 
 		 304 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 295 aa  92.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 301 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 310 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  46.43 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2705  regulatory protein, LysR  38.04 
 
 		 286 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  38.68 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  44.94 
 
 		 317 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  45.98 
 
 		 305 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  45 
 
 		 305 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  41.3 
 
 		 293 aa  76.6  0.00000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1793  transcriptional regulator, LysR family  43.9 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0564115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  41.11 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  43.48 
 
 		 317 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  43.82 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0707  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256747  normal  0.378032 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2614  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2590  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1980  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5143  transcriptional regulator, LysR family  45.33 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  40.22 
 
 		 300 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 319 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 300 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  32.63 
 
 		 302 aa  73.6  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2938  transcriptional regulator, LysR family  31.07 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 293 aa  72.4  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 321 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5921  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 294 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 322 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>