233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1443 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_1443  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  288  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1546  hypothetical protein  98.62 
 
 		 206 aa  285  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1218  hypothetical protein  90 
 
 		 166 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0649  hypothetical protein  89.17 
 
 		 208 aa  206  9e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1414  hypothetical protein  89.53 
 
 		 140 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  58.33 
 
 		 375 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  58.33 
 
 		 375 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  56.94 
 
 		 375 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  56.94 
 
 		 375 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  77.55 
 
 		 375 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  55.38 
 
 		 384 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  50.77 
 
 		 383 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  55.56 
 
 		 383 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.85 
 
 		 384 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  50 
 
 		 381 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  50 
 
 		 381 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  50 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  50 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50 
 
 		 381 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  50 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  50 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  45.9 
 
 		 386 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  50 
 
 		 379 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  44.26 
 
 		 386 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  45.76 
 
 		 386 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  46.97 
 
 		 381 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  46.58 
 
 		 380 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  50.88 
 
 		 379 aa  57  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  51.85 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  50.88 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  51.85 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  45.45 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  45.45 
 
 		 383 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  40.26 
 
 		 367 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  49.09 
 
 		 374 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.1 
 
 		 380 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  47.17 
 
 		 379 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  47.17 
 
 		 377 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  40.62 
 
 		 378 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  49.06 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  47.17 
 
 		 377 aa  50.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  49.06 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  49.06 
 
 		 362 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  49.06 
 
 		 361 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  44.64 
 
 		 379 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  44.64 
 
 		 379 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  44.64 
 
 		 379 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  45.28 
 
 		 380 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  41.07 
 
 		 379 aa  50.4  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.03 
 
 		 396 aa  50.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  40 
 
 		 383 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  44.64 
 
 		 379 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  44.64 
 
 		 379 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  43.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  41.82 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  43.04 
 
 		 376 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 376 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  43.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  43.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.82 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  45.28 
 
 		 379 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  44.07 
 
 		 385 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  43.04 
 
 		 374 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 376 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  47.46 
 
 		 372 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.82 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 376 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  47.46 
 
 		 372 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  41.82 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  41.27 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  45.61 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  44.44 
 
 		 411 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  45.61 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  45.61 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  45.61 
 
 		 394 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  43.64 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  39.44 
 
 		 383 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  44.29 
 
 		 395 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  47.17 
 
 		 372 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  40.91 
 
 		 382 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  38.46 
 
 		 380 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  44.29 
 
 		 395 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  45.76 
 
 		 363 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  43.66 
 
 		 384 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  44.29 
 
 		 395 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  41.56 
 
 		 380 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  34.18 
 
 		 370 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  38.27 
 
 		 355 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  29.91 
 
 		 391 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  40 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  41.94 
 
 		 394 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  36 
 
 		 380 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  42.86 
 
 		 394 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  36 
 
 		 383 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  36 
 
 		 481 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  41.79 
 
 		 359 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2630  OmpC family outer membrane porin  43.1 
 
 		 390 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  40 
 
 		 385 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>