158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_1414 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1414  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  275  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1218  hypothetical protein  98.96 
 
 
166 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0649  hypothetical protein  98.96 
 
 
208 aa  192  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1546  hypothetical protein  89.53 
 
 
206 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1443  hypothetical protein  89.53 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  57.89 
 
 
375 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  57.89 
 
 
375 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  56.58 
 
 
375 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  58.11 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  74.07 
 
 
375 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.11 
 
 
384 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  52.54 
 
 
383 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.72 
 
 
384 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  46.48 
 
 
383 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  43.94 
 
 
386 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  48.57 
 
 
380 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  43.75 
 
 
386 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  42.42 
 
 
386 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  41.67 
 
 
379 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  45.83 
 
 
381 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  47.46 
 
 
379 aa  50.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  41.67 
 
 
381 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  47.46 
 
 
380 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  47.46 
 
 
380 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  47.46 
 
 
380 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  48.33 
 
 
379 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  48.33 
 
 
379 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  42.67 
 
 
367 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  43.06 
 
 
381 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  48.33 
 
 
379 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  48.33 
 
 
379 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  48.33 
 
 
379 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  40.28 
 
 
381 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  70 
 
 
374 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  70 
 
 
383 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  36.11 
 
 
389 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  70 
 
 
383 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  39.24 
 
 
380 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.93 
 
 
384 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.11 
 
 
383 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  52.38 
 
 
379 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36.11 
 
 
383 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36.11 
 
 
383 aa  47.8  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.83 
 
 
379 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  41.79 
 
 
364 aa  47  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  39.06 
 
 
394 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.43 
 
 
380 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  40.58 
 
 
382 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  29.37 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  40.98 
 
 
379 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  29.37 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  37.7 
 
 
379 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  40 
 
 
380 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  58.33 
 
 
380 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  40.98 
 
 
379 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.72 
 
 
385 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  40.98 
 
 
379 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  40.98 
 
 
379 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.72 
 
 
385 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  40.98 
 
 
379 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  29.37 
 
 
362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  42.03 
 
 
384 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.33 
 
 
383 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  42.03 
 
 
384 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  42.03 
 
 
384 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  43.28 
 
 
396 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  63.33 
 
 
376 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  43.75 
 
 
385 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  44.83 
 
 
377 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  64.52 
 
 
391 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  37.68 
 
 
380 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  38.89 
 
 
374 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  41.67 
 
 
382 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  38.89 
 
 
374 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  38.89 
 
 
376 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  38.89 
 
 
376 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  38.89 
 
 
374 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  40.68 
 
 
379 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  38.89 
 
 
374 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  38.89 
 
 
376 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  38.89 
 
 
376 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  55.26 
 
 
395 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  42.37 
 
 
411 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  44.83 
 
 
362 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  55.26 
 
 
395 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  44.83 
 
 
362 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  44.83 
 
 
362 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  44.83 
 
 
377 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  55.26 
 
 
395 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  44.83 
 
 
361 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  40.58 
 
 
384 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  40.3 
 
 
409 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  63.33 
 
 
378 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  37.5 
 
 
354 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  50 
 
 
377 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  40.58 
 
 
384 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>