170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A1218 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A1218  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  331  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0649  hypothetical protein  99.4 
 
 
208 aa  331  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1414  hypothetical protein  97.94 
 
 
140 aa  191  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.291578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1443  hypothetical protein  82.96 
 
 
145 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1546  hypothetical protein  90 
 
 
206 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  54.88 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  54.88 
 
 
375 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  53.66 
 
 
375 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  62.12 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  74.07 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  52.86 
 
 
384 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.86 
 
 
384 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  52.54 
 
 
383 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  47.14 
 
 
383 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  47.89 
 
 
379 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  47.89 
 
 
379 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  47.89 
 
 
379 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  47.89 
 
 
379 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  47.89 
 
 
379 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  47.89 
 
 
379 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  43.94 
 
 
386 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  46.48 
 
 
381 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.48 
 
 
381 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  47.89 
 
 
381 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  43.75 
 
 
386 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  45.07 
 
 
381 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  42.42 
 
 
386 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  44.74 
 
 
380 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  46.77 
 
 
379 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  47.46 
 
 
380 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  47.46 
 
 
380 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.25 
 
 
383 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  42.25 
 
 
383 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  46.77 
 
 
380 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  42.67 
 
 
364 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45 
 
 
374 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  41.77 
 
 
376 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  41.77 
 
 
374 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  41.77 
 
 
374 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.44 
 
 
384 aa  48.9  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  41.77 
 
 
374 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  41.77 
 
 
374 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  41.77 
 
 
376 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  41.77 
 
 
376 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  41.77 
 
 
376 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  39.74 
 
 
380 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  57.78 
 
 
395 aa  47.4  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  57.78 
 
 
395 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  43.04 
 
 
367 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  57.78 
 
 
395 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  44.83 
 
 
379 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  40.24 
 
 
380 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  41.67 
 
 
384 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.67 
 
 
384 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  42.37 
 
 
394 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  38.89 
 
 
383 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  49.12 
 
 
471 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.67 
 
 
384 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  41.67 
 
 
359 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  40 
 
 
389 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1082  porin transmembrane protein  43.48 
 
 
394 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000550491  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  42.67 
 
 
396 aa  45.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  41.67 
 
 
359 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  55.56 
 
 
394 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  42.31 
 
 
376 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  61.54 
 
 
419 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  40 
 
 
383 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  42.31 
 
 
376 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  40 
 
 
383 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  40 
 
 
383 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  42.31 
 
 
376 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  55 
 
 
390 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  63.33 
 
 
376 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  38.16 
 
 
380 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
384 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  53.49 
 
 
359 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
384 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  43.75 
 
 
385 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  40.28 
 
 
384 aa  44.7  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4590  porin  47.46 
 
 
372 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0340402  hitchhiker  0.00422531 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4126  porin  47.46 
 
 
372 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  62.5 
 
 
380 aa  44.7  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  37.7 
 
 
379 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  49.06 
 
 
403 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  49.06 
 
 
403 aa  44.7  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  40.98 
 
 
379 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  40.98 
 
 
379 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  40.98 
 
 
379 aa  44.3  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  38.75 
 
 
384 aa  44.3  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  38.33 
 
 
383 aa  43.9  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  44.83 
 
 
377 aa  44.3  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  32.79 
 
 
362 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  58.33 
 
 
394 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  32.79 
 
 
362 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  37.8 
 
 
357 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  51.16 
 
 
359 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  57.14 
 
 
382 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  52.63 
 
 
378 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  44.83 
 
 
362 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  41.43 
 
 
394 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>