158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_1509 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1229  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  100 
 
 
336 aa  666    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000923659  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1509  sensor histidine kinase  100 
 
 
336 aa  666    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0046637  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  93.54 
 
 
643 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  93.54 
 
 
643 aa  544  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  92.86 
 
 
643 aa  541  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  58.48 
 
 
634 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  53.78 
 
 
615 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.78 
 
 
635 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2150  sensor histidine kinase  44.96 
 
 
591 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.422242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  46.64 
 
 
645 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 
628 aa  168  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  39.83 
 
 
659 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  37.2 
 
 
622 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
668 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
672 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  38.52 
 
 
670 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
623 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  36.61 
 
 
603 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0203  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  40 
 
 
315 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1390  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  40 
 
 
315 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  40 
 
 
677 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  40 
 
 
677 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  40 
 
 
677 aa  149  7e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
631 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
634 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
634 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4339  histidine kinase  38.84 
 
 
600 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5344  histidine kinase  39.53 
 
 
611 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
627 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
638 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  38.14 
 
 
627 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
683 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
627 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  40.28 
 
 
665 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  33.46 
 
 
592 aa  145  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  38.97 
 
 
677 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  34.32 
 
 
666 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  37.55 
 
 
590 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2922  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 
883 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.301068 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  34.51 
 
 
626 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0010  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
884 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
884 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.465168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  33.9 
 
 
666 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  32.57 
 
 
604 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
591 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  37.25 
 
 
616 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
726 aa  140  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388599  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  32.57 
 
 
604 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 
604 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  33.72 
 
 
604 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  33.9 
 
 
669 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  37.07 
 
 
638 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  33.33 
 
 
603 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
597 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
604 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  30.38 
 
 
598 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  36.11 
 
 
602 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
621 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
598 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
669 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 
669 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
598 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
598 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  35.23 
 
 
555 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.85 
 
 
727 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4291  sensor histidine kinase  33.47 
 
 
585 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
652 aa  136  5e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 
672 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  31.8 
 
 
604 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
603 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
603 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3355  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
880 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0607488  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  35.29 
 
 
585 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
603 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  36.92 
 
 
669 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  35.78 
 
 
623 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  34.08 
 
 
604 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
585 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  35.68 
 
 
588 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  35.19 
 
 
597 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02398  sensor histidine kinase  39 
 
 
881 aa  132  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  36.92 
 
 
668 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  35.21 
 
 
586 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  36.32 
 
 
630 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
585 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
618 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  37.06 
 
 
626 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  37.06 
 
 
621 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3912  sensor histidine kinase  32.92 
 
 
635 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.41 
 
 
677 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  34.72 
 
 
600 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  32.37 
 
 
585 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
586 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1611  sensor histidine kinase  36.6 
 
 
597 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  28.57 
 
 
594 aa  125  9e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0265  histidine kinase  35.51 
 
 
597 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.937441  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0914  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
771 aa  125  9e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  37.06 
 
 
621 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
606 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>