More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0348 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0348  ABC transporter related  100 
 
 		 231 aa  466  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.82 
 
 		 230 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1236  ABC transporter, ATP-binding protein  36.53 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0708266  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  40.72 
 
 		 224 aa  158  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  38.18 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  38.5 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2023  ABC transporter, ATP-binding protein  38.22 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.366076  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  42.73 
 
 		 224 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  37.21 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  37.61 
 
 		 228 aa  154  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04772  putative transport protein of outer membrane lipoproteins  35.06 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2210  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00255017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  37.39 
 
 		 233 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02649  hypothetical protein  36.36 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3219  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.568851  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2017  ABC transporter related  40.72 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000531605 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0550  ABC transporter related  36.53 
 
 		 224 aa  152  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0929666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  38.74 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  35.43 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003770  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  36.36 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1311  ABC transporter related  38.18 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.355082  normal  0.912591 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.56 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.684387  normal  0.338705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  38.92 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.7 
 
 		 274 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  38.92 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0908  ABC transporter related  35.91 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1468  ABC transporter related  36.73 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  38.42 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  39.51 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  38.18 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1509  ABC transporter related  36.87 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  38.42 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  37.67 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1100  ABC transporter related  34.23 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6499  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  38.07 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  38.74 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.64 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  36.62 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  37.44 
 
 		 253 aa  148  8e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  34.27 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  36.2 
 
 		 230 aa  147  9e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4731  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4571  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00946862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4591  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4952  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5091  ABC transporter ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 253 aa  147  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  34.76 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4993  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 319 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.11 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1984  ABC transporter related  37.27 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3486  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0894  ABC transporter related  39.91 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.552759  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4980  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4965  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  35.98 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  38.6 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  37.71 
 
 		 408 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  36.57 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0268  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  36.28 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2309  ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0709631  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  39.7 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2427  ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.363639  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  36.82 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  36.84 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 228 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014367 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2603  ABC transporter ATP-binding protein  37.73 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 229 aa  146  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35.16 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  41.75 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.96 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2097  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.07 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  35.91 
 
 		 222 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  40.7 
 
 		 223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  35.16 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1363  ABC transporter related  37.1 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3787  ABC transporter, ATPase subunit  33.18 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0405178  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  35.38 
 
 		 445 aa  145  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>