144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2434 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2434  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1333  Crp/FNR family transcriptional regulator  92.66 
 
 		 218 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2622  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  92.66 
 
 		 218 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2526  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  92.66 
 
 		 218 aa  414  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.421712  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2478  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 249 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4101  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311006  normal  0.0239649 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1040  cyclic nucleotide-binding protein  26.21 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.464794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  31.37 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1550  protein YieJ  26.37 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  29.26 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0436  transcription regulator  22.83 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0316636  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1312  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000433355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0796  cyclic nucleotide-binding protein  24.15 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3610  hypothetical protein  25.12 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0468  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0349  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.3 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181532  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1678  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.330352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.27 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.54 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3150  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 252 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.84 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1092  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.86 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8335  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.05 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.339186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.9 
 
 		 225 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  20.33 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2229  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.06 
 
 		 258 aa  49.7  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.84 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1123  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.24 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.244021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 225 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0212  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 		 254 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 		 293 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3585  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.921585 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1996  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2018  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  18.85 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.831368  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2104  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.96 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.68 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0917  CRP/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 254 aa  46.2  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003082  transcriptional regulator Crp/Fnr family  24.21 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00863529  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 		 354 aa  46.6  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09560  cAMP-binding protein  28.57 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.348668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2551  transcriptional regulator-related protein  25.95 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2014  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  18.85 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000422436 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44490  transcriptional regulator Anr  23.47 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2115  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  18.85 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.508722  normal  0.0650668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 		 350 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3788  transcriptional regulator Anr  23.47 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.620164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.37 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.49 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24470  cAMP-binding protein  27.42 
 
 		 261 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1786  cyclic nucleotide-binding protein  25 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.150342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 267 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 244 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0359086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3425  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.47 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0533041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1843  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  19.37 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177159  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.76 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 251 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13707  Cpr/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333343 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4874  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 207 aa  45.1  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0407  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.74 
 
 		 243 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5783  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.03 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00268451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1811  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2158  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.198273  normal  0.103025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4818  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8981  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.06 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.18 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4904  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5205  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.703662  hitchhiker  0.000819508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.44 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0252  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000185636  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1533  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 231 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.32 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.4 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1512  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  20.62 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000347396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1961  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  18.32 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00754009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5435  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397858 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1951  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  17.8 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.80493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5746  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.765257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2582  fumarate/nitrate reduction transcriptional regulator  19.77 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3421  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25 
 
 		 232 aa  43.5  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3830  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525453 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3583  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4265  transcriptional regulator Anr  23.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3066  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2530  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1603  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.09 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>