More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_0287 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0287  RluA family pseudouridine synthase  100 
 
 
311 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.702234  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0276  pseudouridine synthase, RluA family  81.09 
 
 
312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0265  pseudouridine synthase, RluD  82.05 
 
 
312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.187566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0287  pseudouridine synthase, RluA family  81.73 
 
 
312 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.425665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2289  pseudouridine synthase, RluA family  41.75 
 
 
310 aa  170  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.677026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0254  RluA family pseudouridine synthase  42 
 
 
316 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128568  normal  0.0139126 
 
 
-
 
NC_002936  DET1375  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.79 
 
 
300 aa  160  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000447138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  41.53 
 
 
299 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0282  RluA family pseudouridine synthase  40.47 
 
 
315 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.418859  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1893  pseudouridine synthase, RluA family  39.47 
 
 
345 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  38.73 
 
 
315 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0949  RluA family pseudouridine synthase  40.56 
 
 
309 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1156  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  37.46 
 
 
302 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0116106  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.87 
 
 
313 aa  155  7e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  39.42 
 
 
314 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  38.27 
 
 
319 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4642  pseudouridine synthase, RluA family  37.34 
 
 
313 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  40.45 
 
 
313 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1186  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.09 
 
 
300 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204845  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  40.92 
 
 
331 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  36.65 
 
 
329 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2615  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.24 
 
 
344 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0357699  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28001  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  36.7 
 
 
324 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2141  pseudouridine synthase, RluD  34.41 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0810  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.54 
 
 
318 aa  147  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.043607  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  39.74 
 
 
334 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  34.55 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  34.55 
 
 
311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2363  pseudouridine synthase, RluA family  32.66 
 
 
305 aa  145  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1560  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33 
 
 
326 aa  145  8.000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2950  RluA family pseudouridine synthase  34.16 
 
 
323 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00118178  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.36 
 
 
438 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  32.89 
 
 
306 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  38.59 
 
 
327 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  36.06 
 
 
405 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  36.06 
 
 
407 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.31 
 
 
333 aa  144  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02691  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.44 
 
 
326 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.88343  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0554  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.89 
 
 
296 aa  143  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0069072  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  32.8 
 
 
352 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2457  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.1 
 
 
333 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1082  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  31.53 
 
 
301 aa  143  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.463864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  32.91 
 
 
352 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2550  pseudouridine synthase, RluD  34.35 
 
 
319 aa  142  6e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.347335  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  37.12 
 
 
395 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.12 
 
 
395 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.12 
 
 
395 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.65 
 
 
320 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3056  pseudouridine synthase, RluA family  31.1 
 
 
305 aa  142  8e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  35.76 
 
 
431 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  32.91 
 
 
352 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  37.42 
 
 
389 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  37.12 
 
 
389 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  37.12 
 
 
389 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  37.12 
 
 
389 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3477  23S rRNA pseudouridine synthase D  33.97 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.118484  normal  0.239433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  37.46 
 
 
391 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.8 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3351  23S rRNA pseudouridine synthase D  33.97 
 
 
325 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11955  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  34.84 
 
 
320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000135219 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  35.19 
 
 
320 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.45 
 
 
402 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  35.45 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  35.15 
 
 
360 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1335  RluA family pseudouridine synthase  33.23 
 
 
327 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000257398  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02111  putative pseudouridylate synthase specific to ribosomal large subunit  33.78 
 
 
327 aa  139  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  35.15 
 
 
402 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  35.15 
 
 
402 aa  139  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  35.09 
 
 
331 aa  139  7.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  35.05 
 
 
326 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0884  23S rRNA pseudouridine synthase D  32.42 
 
 
325 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0692792  normal  0.0818759 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0593  pseudouridine synthase, RluA family  35.71 
 
 
310 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.070842  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0881  RluA family pseudouridine synthase  32.79 
 
 
320 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000267472  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  34.32 
 
 
304 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0431  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.71 
 
 
319 aa  137  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.37 
 
 
320 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587851  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0726  pseudouridine synthase, RluD  32.37 
 
 
320 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1344  pseudouridine synthase, RluA family  36 
 
 
313 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  35.11 
 
 
318 aa  137  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1084  pseudouridine synthase, RluA family  34.11 
 
 
313 aa  137  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1365  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.82 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00766831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3435  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  35.28 
 
 
319 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  34.47 
 
 
327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1673  RluA family pseudouridine synthase  33.77 
 
 
306 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.529944  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  35.49 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004394  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  33.44 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.530574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1286  pseudouridylate synthase  32.45 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00677773  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1958  RluA family pseudouridine synthase  38.38 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.576308  normal  0.790812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1604  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  36.25 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0610  pseudouridine synthase, RluA family  30.25 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1288  RluA family pseudouridine synthase  33.46 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.543506  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2605  pseudouridylate synthase  33.02 
 
 
324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000283334  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2995  pseudouridine synthase, RluA family  36.67 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.34011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1022  RluA family pseudouridine synthase  34.06 
 
 
324 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000246501  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  34.51 
 
 
336 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0008  pseudouridine synthase, RluA family  33.99 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3166  RluA family pseudouridine synthase  32.29 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133464  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1102  RluA family pseudouridine synthase  30.46 
 
 
314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1620  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  34.62 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.27015  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0367  23S rRNA pseudouridine synthase D  32.81 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>