More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2024 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2024  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 167 aa  340  5e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000145262 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  41.83 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.54 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  36.36 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  39.74 
 
 		 180 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  37.04 
 
 		 173 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  38.96 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  37.66 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  37.75 
 
 		 161 aa  104  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  38.36 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.06 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  42.22 
 
 		 167 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.83 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.41 
 
 		 191 aa  103  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  37.5 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.09 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.74 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.01 
 
 		 164 aa  101  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  36.18 
 
 		 156 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  35.1 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.71 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  34.84 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.53 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.16 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  35.81 
 
 		 170 aa  97.4  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.77 
 
 		 192 aa  96.7  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.85 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.65 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.85 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  31.41 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1250  Holliday junction resolvase  40.54 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 191 aa  94.7  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.58 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.97 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01556  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.244757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 161 aa  94.4  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  36.88 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  34.87 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2017  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.55 
 
 		 171 aa  94  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.365662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  35.53 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1250  Holliday junction resolvase  40.54 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  38.24 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.46 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  36.09 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  34.32 
 
 		 174 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.12 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.8 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.86 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  34.15 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.88 
 
 		 191 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  33.78 
 
 		 173 aa  92  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.31 
 
 		 164 aa  92.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  34.15 
 
 		 174 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  34.32 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  34.59 
 
 		 183 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 186 aa  91.7  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  33.54 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  33.54 
 
 		 180 aa  91.3  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  33.78 
 
 		 173 aa  91.3  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  37.18 
 
 		 186 aa  91.3  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0941  Holliday junction resolvase  34.67 
 
 		 204 aa  90.9  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1060  Holliday junction resolvase  34.67 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  33.76 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  34.39 
 
 		 183 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  31.37 
 
 		 181 aa  90.5  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  33.54 
 
 		 180 aa  90.5  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  32 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  32.48 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  32.91 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0784  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 169 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193363  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  32.48 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.07 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  36 
 
 		 169 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.58 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2947  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.977877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  35.44 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.29 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  31.21 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  32.72 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.86 
 
 		 175 aa  89.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.39 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  32.03 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 182 aa  89  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2305  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00234267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2040  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000885772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  37.89 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2421  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000504743  normal  0.0281023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2042  Holliday junction resolvase  37.11 
 
 		 173 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000214475  hitchhiker  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  36.94 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>