More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11451 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  100 
 
 
157 aa  318  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  82.17 
 
 
157 aa  267  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  80.89 
 
 
157 aa  267  5e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  81.53 
 
 
157 aa  265  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11371  Holliday junction resolvase  57.72 
 
 
158 aa  185  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.925664 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0712  Holliday junction resolvase  57.66 
 
 
154 aa  173  6e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08941  Holliday junction resolvase  57.66 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.659645 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15331  Holliday junction resolvase  59.12 
 
 
154 aa  172  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0699  Holliday junction resolvase  58.39 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1953  Holliday junction resolvase  56.2 
 
 
154 aa  171  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.464779  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0918  Holliday junction resolvase  47.86 
 
 
157 aa  137  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.2 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 
156 aa  130  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  43.05 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0115  Holliday junction resolvase  45.21 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.44178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4457  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.52 
 
 
163 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  41.72 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.48 
 
 
166 aa  123  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 
164 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  38.31 
 
 
182 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  46.38 
 
 
200 aa  121  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 
166 aa  121  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
168 aa  120  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3620  Holliday junction resolvase  44.14 
 
 
163 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  42.86 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0798  Holliday junction resolvase  43.66 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.31 
 
 
189 aa  119  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 
178 aa  118  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  39.87 
 
 
165 aa  117  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.06 
 
 
164 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 
162 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.06 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.95 
 
 
157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 
164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.78 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  43.14 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.07 
 
 
163 aa  110  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.55 
 
 
184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1604  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.44 
 
 
192 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000814107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.84 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 
159 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  39.72 
 
 
165 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.75 
 
 
191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  41.84 
 
 
157 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  42.03 
 
 
163 aa  107  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.42 
 
 
165 aa  107  6e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 
164 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2726  Holliday junction resolvase  41.8 
 
 
172 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 
164 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  37.34 
 
 
164 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0361  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 
165 aa  105  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0343  Holliday junction resolvase  46.1 
 
 
165 aa  105  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.97 
 
 
191 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.81 
 
 
190 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  34.87 
 
 
173 aa  104  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  35.76 
 
 
181 aa  104  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
181 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3065  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
169 aa  103  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.31187  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 
181 aa  103  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 
168 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1582  Holliday junction resolvase  36.94 
 
 
168 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.330429  normal  0.489243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3523  Holliday junction resolvase  40.16 
 
 
178 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  36.08 
 
 
164 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  34.42 
 
 
168 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  38.85 
 
 
180 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.12 
 
 
160 aa  101  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  34.64 
 
 
181 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6909  Holliday junction resolvase  40.29 
 
 
175 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.293196 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0583  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 
183 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0609  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 
183 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0892  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.18 
 
 
172 aa  100  6e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00082317  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  37.91 
 
 
180 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.26 
 
 
166 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1217  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.82 
 
 
164 aa  100  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.331391  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1878  Holliday junction resolvase  34.81 
 
 
172 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00784729  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.84 
 
 
164 aa  100  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 
181 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1083  Holliday junction resolvase  36.13 
 
 
182 aa  99.8  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00107185  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0207  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 
180 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0690  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 
180 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3512  Holliday junction resolvase  39.34 
 
 
169 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658473  normal  0.710668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2355  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0617  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.481352 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3343  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00888007 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3776  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 
180 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.518042  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
284 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  32.68 
 
 
170 aa  98.2  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
275 aa  98.2  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2554  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 
180 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250708  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2639  Holliday junction resolvase  38.52 
 
 
167 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0657  Holliday junction resolvase  35.29 
 
 
180 aa  97.4  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4272  Holliday junction resolvase  40.16 
 
 
198 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0821163  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4806  Holliday junction resolvase  40.16 
 
 
175 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  33.11 
 
 
173 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>