More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0972 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0972  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 
192 aa  390  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108753 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07030  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.74 
 
 
165 aa  220  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000194314  normal  0.296999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12860  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.43 
 
 
174 aa  218  5e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0895  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.35 
 
 
167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000302066  normal  0.153116 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.32 
 
 
163 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  50 
 
 
164 aa  156  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  42.67 
 
 
161 aa  147  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.2 
 
 
179 aa  144  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.99 
 
 
165 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  43.83 
 
 
165 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  39.75 
 
 
166 aa  141  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  43.42 
 
 
159 aa  141  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  40.27 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  38.89 
 
 
182 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 
164 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.72 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  46.84 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  42.77 
 
 
180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1864  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.93 
 
 
178 aa  132  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000897484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  47.13 
 
 
164 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  44.31 
 
 
173 aa  131  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  49.65 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  47.44 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.22 
 
 
160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.34 
 
 
164 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.42 
 
 
162 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  43.86 
 
 
176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  48.32 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  45.7 
 
 
164 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  47.24 
 
 
168 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  45.16 
 
 
164 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  44.97 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.31 
 
 
173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.41 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  47.37 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  43.62 
 
 
181 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  35.71 
 
 
158 aa  125  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1720  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.24 
 
 
166 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.029168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  49.67 
 
 
184 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  43.71 
 
 
173 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3417  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 
182 aa  124  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3856  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  37.74 
 
 
164 aa  124  9e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  39.6 
 
 
156 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
181 aa  124  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
174 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  47.68 
 
 
175 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0556  Holliday junction resolvase  45.1 
 
 
168 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.657324  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  47.33 
 
 
173 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2208  Holliday junction resolvase  45.75 
 
 
168 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147946  normal  0.881162 
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.14 
 
 
165 aa  123  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  42.95 
 
 
181 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  44.3 
 
 
181 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  41.77 
 
 
165 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  45.64 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1218  Holliday junction resolvase  43.48 
 
 
168 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.806199 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1038  Holliday junction resolvase  41.89 
 
 
157 aa  123  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0318292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  32.97 
 
 
200 aa  122  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.95 
 
 
158 aa  121  7e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 
173 aa  121  7e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  45.95 
 
 
164 aa  120  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  41.51 
 
 
165 aa  120  8e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  44.08 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.3 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.93 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  40.26 
 
 
163 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  45.12 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3658  Holliday junction resolvase  45.73 
 
 
186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.33 
 
 
176 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0531  Holliday junction resolvase  47.06 
 
 
183 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.33 
 
 
166 aa  119  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  40.94 
 
 
172 aa  119  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
174 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  44.38 
 
 
168 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 
173 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0696  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.24 
 
 
164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.381333  normal  0.521985 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  44.51 
 
 
173 aa  118  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  46.31 
 
 
174 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  39.51 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  46.67 
 
 
189 aa  117  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0336  Holliday junction resolvase  42.48 
 
 
156 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248302  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0151  Holliday junction resolvase  38.36 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.4 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  44.38 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.01 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1818  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
173 aa  115  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.311556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2102  Holliday junction resolvase  44.44 
 
 
173 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01834  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.837934  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1777  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00202932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1109  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1323  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2599  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.109079  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1769  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0125353  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01822  hypothetical protein  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.621329  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1885  Holliday junction resolvase  44.58 
 
 
173 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.94551  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1956  Holliday junction resolvase  45.19 
 
 
173 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.396234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.14 
 
 
187 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>