More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_4107 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_4107  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  100 
 
 
429 aa  783    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4258  Fmu (Sun) domain protein  91.95 
 
 
410 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4235  Fmu (Sun) domain protein  90.73 
 
 
410 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4268  Fmu (Sun) domain-containing protein  71.6 
 
 
414 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.48 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  39.76 
 
 
421 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  41.08 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  41.96 
 
 
447 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.26 
 
 
437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  41.2 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  41.2 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  41.2 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  39.66 
 
 
420 aa  213  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  41.2 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  41.2 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  41.2 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  41.2 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  40 
 
 
417 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.89 
 
 
424 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.42 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.42 
 
 
420 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.8 
 
 
425 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  39.8 
 
 
425 aa  209  7e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  39.8 
 
 
420 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.28 
 
 
421 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  39.64 
 
 
417 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  35.95 
 
 
423 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.95 
 
 
419 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.35 
 
 
470 aa  202  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.22 
 
 
421 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  38.22 
 
 
421 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.22 
 
 
421 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  40.1 
 
 
419 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  43.35 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  41.35 
 
 
429 aa  197  3e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  43.79 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.11 
 
 
465 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  36.25 
 
 
416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  41.5 
 
 
464 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  33.41 
 
 
519 aa  190  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46635  predicted protein  43.96 
 
 
359 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.247444  decreased coverage  0.000750659 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  42.39 
 
 
425 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  36.71 
 
 
465 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  36.71 
 
 
465 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  42.11 
 
 
436 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.19 
 
 
423 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  40 
 
 
453 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  35 
 
 
423 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  36.64 
 
 
417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  37.53 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  41.4 
 
 
437 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  32.48 
 
 
443 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  32.44 
 
 
410 aa  177  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  39.37 
 
 
466 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.42 
 
 
403 aa  177  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  44.67 
 
 
429 aa  176  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  37.34 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  41.87 
 
 
437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  42.02 
 
 
478 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.56 
 
 
451 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  40.85 
 
 
454 aa  172  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  38.21 
 
 
468 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.31 
 
 
404 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.02 
 
 
433 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  35.97 
 
 
453 aa  170  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  38.56 
 
 
432 aa  169  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.74 
 
 
446 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  42.62 
 
 
395 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.85 
 
 
452 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  36.99 
 
 
428 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  38.58 
 
 
449 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.3 
 
 
433 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  37.56 
 
 
433 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.91 
 
 
426 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  36.04 
 
 
448 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.08 
 
 
449 aa  162  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  36.54 
 
 
448 aa  161  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  37.02 
 
 
415 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  37.75 
 
 
452 aa  159  6e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  36.22 
 
 
448 aa  159  7e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  33.11 
 
 
452 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.75 
 
 
432 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  31.77 
 
 
412 aa  158  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  35.39 
 
 
427 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.37 
 
 
404 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  42.06 
 
 
501 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  34.74 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  38.46 
 
 
434 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  39.32 
 
 
457 aa  156  7e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.55 
 
 
418 aa  156  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  30.84 
 
 
442 aa  155  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.76 
 
 
434 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.69 
 
 
429 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.57 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2006  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.34 
 
 
405 aa  153  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.792625  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2178  Fmu (Sun) domain protein  36.65 
 
 
430 aa  153  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.94 
 
 
429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  27.99 
 
 
443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.96 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  41.18 
 
 
416 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>