More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4258 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4258  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
410 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4235  Fmu (Sun) domain protein  96.1 
 
 
410 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4107  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  91.95 
 
 
429 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4268  Fmu (Sun) domain-containing protein  72.49 
 
 
414 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.117178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0741  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.96 
 
 
418 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1826  Fmu (Sun) domain protein  41.37 
 
 
447 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.14033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5841  methylase  39.04 
 
 
421 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3217  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.92 
 
 
417 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.44 
 
 
437 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2427  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.52 
 
 
420 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  hitchhiker  0.000000717597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3433  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.98 
 
 
424 aa  207  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.593781 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2556  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.52 
 
 
420 aa  207  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0810  NOL1/NOP2/Sun family protein  39.09 
 
 
419 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1127  NOL1/NOP2/Sun family protein  39.04 
 
 
420 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3387  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.78 
 
 
425 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228873 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0974  rRNA small subunit methyltransferase B  39.04 
 
 
420 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0970  rRNA small subunit methyltransferase B  39.04 
 
 
420 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2725  Fmu (Sun) domain protein  38.78 
 
 
425 aa  206  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0161208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0773  NOL1/NOP2/sun family protein  38.76 
 
 
420 aa  205  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1279  Fmu (Sun) domain protein  35.95 
 
 
423 aa  205  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3805  Fmu (Sun)  38.77 
 
 
417 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1030  rRNA small subunit methyltransferase B  39.04 
 
 
420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2239  NOL1/NOP2/sun family protein  39.04 
 
 
420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2655  rRNA small subunit methyltransferase B  39.04 
 
 
420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.768959  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2109  rRNA small subunit methyltransferase B  39.04 
 
 
420 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.324014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3159  Fmu (Sun)/ nucleolar NOL1/Nop2p  40.05 
 
 
420 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876186  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0786  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.28 
 
 
421 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.252501  normal  0.0209152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5370  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.17 
 
 
470 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2534  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.46 
 
 
421 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.157986 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1898  Fmu (Sun)  38.46 
 
 
421 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2509  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.46 
 
 
421 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  43.14 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3156  Fmu (Sun) domain protein  39.09 
 
 
419 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00826214  normal  0.0267746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.76 
 
 
419 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  40.18 
 
 
464 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  41.53 
 
 
434 aa  189  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0208  Fmu (Sun)  36.56 
 
 
416 aa  186  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0562281  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3183  Fmu (Sun)  39.74 
 
 
429 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2721  Fmu (Sun) domain protein  41.33 
 
 
465 aa  184  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2332  Fmu (Sun) domain protein  41.33 
 
 
465 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.797213  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2100  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.84 
 
 
423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.917704  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1737  Fmu (Sun) domain-containing protein  34.21 
 
 
465 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10303  putative sun protein  33.42 
 
 
403 aa  180  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.739965  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1088  Fmu (Sun) domain protein  32.44 
 
 
410 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.263918  normal  0.824497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0287  Fmu (Sun) domain protein  40.05 
 
 
436 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46635  predicted protein  42.62 
 
 
359 aa  179  7e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.247444  decreased coverage  0.000750659 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  33.94 
 
 
451 aa  179  9e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2740  Fmu  41.29 
 
 
425 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2453  hypothetical protein  40.73 
 
 
417 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2256  Fmu (Sun) domain protein  40.59 
 
 
460 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1455  Fmu (Sun) domain protein  32.56 
 
 
519 aa  176  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.653604 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  38.49 
 
 
453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2620  Fmu (Sun) NOL1/Nop2p  33.58 
 
 
423 aa  173  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1753  Fmu (Sun)  42.76 
 
 
395 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.41639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0298  Fmu (Sun) domain protein  40.29 
 
 
437 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583508  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  39.87 
 
 
451 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1169  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.63 
 
 
433 aa  170  5e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2877  Fmu (Sun)  38.78 
 
 
466 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.514648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0041  Fmu (Sun) domain protein  43.33 
 
 
429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0290065  normal  0.0804163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3613  putative SUN-family protein, RNA methyltransferase  37.83 
 
 
432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.417136  normal  0.0469155 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.08 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0276  methyltransferase  39.85 
 
 
437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.398317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  38.02 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  37.78 
 
 
452 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.94 
 
 
443 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0243  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  40.2 
 
 
454 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4781  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.05 
 
 
404 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.57507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  33.14 
 
 
453 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0336  Sun protein  35.82 
 
 
428 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0941  Fmu (Sun) domain-containing protein  39.67 
 
 
478 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.225173  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  41.76 
 
 
501 aa  160  5e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0447  Fmu (Sun) domain-containing protein  38.44 
 
 
433 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.256405 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2497  Fmu (Sun) domain protein  37.66 
 
 
433 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2144  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  36.89 
 
 
432 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.9 
 
 
448 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0464  Fmu (Sun)  37.17 
 
 
427 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3530  Fmu (Sun) domain-containing protein  35.14 
 
 
429 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3190  RNA methyltransferase  38.54 
 
 
434 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1193  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.66 
 
 
426 aa  156  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.637643  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1547  Fmu (Sun) domain protein  31.63 
 
 
412 aa  155  9e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.631705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3064  Fmu (Sun)  34.33 
 
 
433 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456918  normal  0.0535493 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  35.58 
 
 
448 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  36.54 
 
 
468 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  32.8 
 
 
442 aa  155  1e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0358  sun protein, putative  35.75 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685292  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  32.31 
 
 
444 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  32.62 
 
 
444 aa  152  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2598  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  34.85 
 
 
415 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.55407  normal  0.490285 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0325  putative sun protein  36.36 
 
 
429 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2268  Fmu (Sun)  36.99 
 
 
434 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250552  normal  0.130631 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1790  Fmu (Sun) domain-containing protein  39 
 
 
404 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0241833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1664  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  41.09 
 
 
416 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0420674  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  32.62 
 
 
444 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.6 
 
 
449 aa  150  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.46 
 
 
448 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  32.92 
 
 
444 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1891  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.87 
 
 
418 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.556446 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3055  Fmu (Sun) domain-containing protein  36.03 
 
 
429 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1799  Fmu (Sun) domain-containing protein  37.72 
 
 
404 aa  149  8e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1227  Fmu (Sun)  32.25 
 
 
391 aa  149  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>