More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3209 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3209  response regulator receiver protein  100 
 
 		 122 aa  243  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.770272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4156  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000307056  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2562  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 		 437 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3094  response regulator receiver protein  41.53 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4465  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 437 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3195  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 		 1164 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  41.35 
 
 		 1164 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0447  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 229 aa  67.8  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000245325  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.54 
 
 		 224 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 224 aa  67  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2995  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3086  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.27 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.151774  normal  0.916258 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2235  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  29.82 
 
 		 1629 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0323  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4238  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.84 
 
 		 356 aa  65.5  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1861  two component transcriptional regulator  34.68 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000248634  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 980 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 		 826 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.52 
 
 		 337 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  36.59 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1879  two component transcriptional regulator  36.94 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0517799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  39.67 
 
 		 785 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  35.04 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  39.67 
 
 		 785 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 242 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2107  hypothetical protein  34.4 
 
 		 676 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0525  two component transcriptional regulator / cell cycle transcriptional regulator CtrA  33.64 
 
 		 239 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2330  response regulator receiver domain-containing protein  33.05 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 		 458 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3066  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.51 
 
 		 305 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1354  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 349 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 242 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 240 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 247 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.1 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0252  putative PAS/PAC sensor protein  34.78 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  37.38 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3000  response regulator receiver protein  32 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 653 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0979  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3002  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.67465  normal  0.369251 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  39.17 
 
 		 772 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3123  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.09 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.48 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2804  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 494 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202391  normal  0.972852 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.71 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2731  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 505 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.487615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 846 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  33.91 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  31.71 
 
 		 380 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  38.02 
 
 		 785 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2805  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 224 aa  62  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2924  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 470 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.777319  hitchhiker  0.0000000000564278 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2726  two component response regulator  36.94 
 
 		 277 aa  61.6  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0933  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 		 760 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.964864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2903  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4322  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 444 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.713581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  32.2 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  33.06 
 
 		 241 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1764  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807336  hitchhiker  0.00538862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0717  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2408  response regulator receiver protein  47.14 
 
 		 276 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12431  two-component response regulator, phosphate  33.6 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.15803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  33.9 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0188  two component transcriptional regulator  33.62 
 
 		 245 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00347389  normal  0.0545477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4220  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1795  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 274 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00918371  hitchhiker  0.000651153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4223  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000102305  normal  0.0938221 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68250  two-component response regulator  38.14 
 
 		 462 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371358  normal  0.144717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4017  osmolarity response regulator  32.17 
 
 		 241 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.91 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0598  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  31.58 
 
 		 470 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.885444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  31.71 
 
 		 380 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3270  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.538433 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4119  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 440 aa  60.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3669  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  39.67 
 
 		 786 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4247  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.29812  normal  0.0988817 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.17 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4141  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0723203  normal  0.19792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  60.8  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>