More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0488 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0488  response regulator receiver protein  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5999  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 280 aa  87  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3548  response regulator receiver protein  40.66 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0400953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3202  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 117 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.529191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1937  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 117 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  41.46 
 
 		 2301 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3833  response regulator receiver protein  39.56 
 
 		 117 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 1907 aa  77  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4016  response regulator receiver protein  45.05 
 
 		 116 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3956  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.314568 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  41.46 
 
 		 2284 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0824  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.494027  normal  0.693271 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 1646 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 1646 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 1647 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3967  CheA signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 2414 aa  73.6  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0139967 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 1629 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.29 
 
 		 2336 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0483  response regulator receiver domain-containing protein  45.05 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1447  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.53 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2155  CheA signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 1609 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  40.74 
 
 		 1643 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0092  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 120 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2548  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  40 
 
 		 1960 aa  71.6  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.798517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  38.38 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  38.82 
 
 		 1866 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.75 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 1974 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 804 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 806 aa  70.1  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  37.5 
 
 		 998 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.24 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 1361 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0843  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.774989  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1221  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2157  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0519  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.58 
 
 		 1029 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.25 
 
 		 1002 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  41.98 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  36.51 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1367  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  42.5 
 
 		 905 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0722784  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3622  response regulator receiver protein  38.24 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3713  response regulator receiver domain-containing protein  38.55 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  44 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5041  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0669  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00304574  normal  0.832292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 767 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0130  response regulator receiver  37.04 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  40 
 
 		 2458 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1110  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00277439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3634  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.185946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0398  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  34.94 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.74 
 
 		 789 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  40 
 
 		 2092 aa  67.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  37.23 
 
 		 2070 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 1385 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  42.86 
 
 		 734 aa  68.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4086  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0365078  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  40 
 
 		 2476 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  36.25 
 
 		 1987 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  36.25 
 
 		 1992 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  37.8 
 
 		 1366 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0473  response regulator receiver protein  37.11 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.950452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  40.74 
 
 		 394 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4991  response regulator receiver protein  41.56 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.353726  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  40.74 
 
 		 793 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 1758 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3704  response regulator receiver domain-containing protein  35.65 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.600519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4865  response regulator receiver protein  41.56 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321258  normal  0.0275279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 766 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  35.85 
 
 		 312 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  34.92 
 
 		 314 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  36.27 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  39.29 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  41.35 
 
 		 120 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3574  CheA signal transduction histidine kinases  41.25 
 
 		 2026 aa  67  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.906934  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2897  CheA signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 2026 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.855039  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  40 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.96 
 
 		 225 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 2164 aa  67  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 2423 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 1131 aa  67  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  41.25 
 
 		 2022 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  41.03 
 
 		 764 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  41.03 
 
 		 769 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 707 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2887  LuxR family two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 225 aa  67  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.526109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 765 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1817  CheA signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 937 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.717242  normal  0.142765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.96 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  39.74 
 
 		 832 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>