More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2548 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  100 
 
 
312 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  69.97 
 
 
316 aa  454  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  62.46 
 
 
314 aa  408  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  63.31 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  60.84 
 
 
313 aa  385  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  60.13 
 
 
313 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  61.69 
 
 
312 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  39.32 
 
 
326 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  39.32 
 
 
326 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  39.32 
 
 
326 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  39.32 
 
 
326 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  39.32 
 
 
326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  38.92 
 
 
328 aa  220  3e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  39.32 
 
 
324 aa  219  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  38.82 
 
 
326 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  38.68 
 
 
326 aa  215  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  39.21 
 
 
336 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  37.93 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  39.3 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  40.45 
 
 
318 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  41.27 
 
 
308 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  39.81 
 
 
316 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  39.55 
 
 
301 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  39.48 
 
 
320 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  39.12 
 
 
317 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  38.91 
 
 
318 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  39.23 
 
 
321 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.16 
 
 
312 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  34.19 
 
 
311 aa  188  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  37.9 
 
 
302 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  37.34 
 
 
323 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  38.14 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  37.58 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  37.58 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  37.58 
 
 
302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  37.74 
 
 
316 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  37.26 
 
 
302 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  36.94 
 
 
302 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  37.26 
 
 
302 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  36.94 
 
 
302 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  36.62 
 
 
302 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  34.54 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  33.6 
 
 
390 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  33.22 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  34.77 
 
 
316 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  34.98 
 
 
317 aa  170  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  33.98 
 
 
318 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  34 
 
 
346 aa  169  6e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  33.77 
 
 
315 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.56 
 
 
313 aa  168  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  34.75 
 
 
317 aa  167  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  33.02 
 
 
324 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  33.86 
 
 
301 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  31.46 
 
 
311 aa  145  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  32.71 
 
 
319 aa  145  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  30.49 
 
 
318 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  31.97 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  31.37 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  30.43 
 
 
322 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  30.9 
 
 
308 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2340  chemotaxis protein methyltransferase CheV  32.34 
 
 
306 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  31.89 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  27.96 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  29.93 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  28.66 
 
 
325 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  28.1 
 
 
321 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  30.98 
 
 
310 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  30.97 
 
 
312 aa  132  9e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  29.64 
 
 
321 aa  132  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  28.43 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  28.43 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  30.64 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  31.18 
 
 
313 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  31.01 
 
 
333 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  29.29 
 
 
325 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  29.29 
 
 
326 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  31.23 
 
 
308 aa  130  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2658  CheW protein  31.01 
 
 
333 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2819  putative CheW protein  31.4 
 
 
330 aa  129  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2543  CheW protein  30.62 
 
 
334 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2554  CheW protein  30.62 
 
 
334 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.977607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  30.69 
 
 
310 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2499  CheW protein  30.23 
 
 
334 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.55114  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  29.73 
 
 
324 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  28.43 
 
 
316 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  28.62 
 
 
309 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1063  putative CheW protein  29.71 
 
 
307 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  30.32 
 
 
309 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  30.07 
 
 
310 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  29.9 
 
 
311 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  29.69 
 
 
311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  30.2 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  30.2 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  29.49 
 
 
309 aa  119  6e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  29.43 
 
 
309 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  30.41 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  30.38 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  30.26 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>