More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1997 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  100 
 
 		 320 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  75.47 
 
 		 323 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  64.58 
 
 		 318 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  55.62 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  58.54 
 
 		 346 aa  363  2e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  55.7 
 
 		 318 aa  355  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  50.74 
 
 		 336 aa  340  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  53.31 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  55.62 
 
 		 316 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  44.73 
 
 		 390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  49.84 
 
 		 312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  47.47 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  42.54 
 
 		 315 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  42.9 
 
 		 312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  40.58 
 
 		 328 aa  239  6.999999999999999e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  41.23 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  40.91 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  41.03 
 
 		 326 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  39.63 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  39.63 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  39.63 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  39.63 
 
 		 326 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  42.72 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  41.08 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  42.26 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  38.08 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  40.32 
 
 		 324 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  43.09 
 
 		 301 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  41.61 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  40.26 
 
 		 316 aa  211  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  39.48 
 
 		 312 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  39.42 
 
 		 308 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  38.75 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  38.44 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  38.44 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  38.44 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  39.5 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  38.44 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  38.44 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  38.44 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  39.18 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  34.6 
 
 		 302 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  39.12 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  37.46 
 
 		 346 aa  179  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  36.39 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  37.3 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  33.85 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  34.06 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  32.6 
 
 		 317 aa  162  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  32.82 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  32.82 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  33.85 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  32.82 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  35.06 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  34.3 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  34.3 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  31.03 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  34.73 
 
 		 311 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  31.33 
 
 		 321 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  31.21 
 
 		 321 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  36.9 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1794  chemotaxis protein CheV  34.22 
 
 		 308 aa  149  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  35.03 
 
 		 312 aa  148  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  34.44 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  34.81 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.18 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  34.45 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  34.11 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.23 
 
 		 320 aa  146  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  34.37 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  33.22 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  32.89 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  33.9 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  33.55 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  34.24 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  34.24 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  34.24 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  34.24 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  29.69 
 
 		 325 aa  142  6e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  34.24 
 
 		 306 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.12 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  32.09 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  32.09 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2215  putative chemotaxis protein  33.12 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  34.24 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  35.33 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  35.33 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  33.9 
 
 		 306 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  30.5 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  32.36 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  32.9 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  34.33 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  30.7 
 
 		 313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0364  response regulator receiver modulated CheW protein  33.67 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  32.57 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  32.57 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1215  response regulator receiver modulated CheW protein  33.95 
 
 		 310 aa  135  7.000000000000001e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.186708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>