More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1579 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  100 
 
 
317 aa  632  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  90.54 
 
 
317 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  73.35 
 
 
316 aa  478  1e-134  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  74.68 
 
 
318 aa  479  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1370  chemotaxis protein CheV  71.92 
 
 
317 aa  456  1e-127  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  69.18 
 
 
318 aa  454  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  69.18 
 
 
318 aa  454  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  68.55 
 
 
318 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1531  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  62.38 
 
 
313 aa  411  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.577848  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  40.58 
 
 
311 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  39.6 
 
 
346 aa  209  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  34.58 
 
 
316 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  34.54 
 
 
312 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  34.49 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  33.73 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  34.19 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  36.75 
 
 
313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  36.69 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  35.06 
 
 
346 aa  169  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  34.19 
 
 
301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.12 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1592  chemotaxis protein CheV  32.21 
 
 
314 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  37.29 
 
 
314 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  29.87 
 
 
328 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  31.94 
 
 
309 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  34.54 
 
 
316 aa  160  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1989  chemotaxis protein CheV  31.48 
 
 
314 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2272  response regulator receiver modulated CheW protein  31.48 
 
 
314 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.740501  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  33.45 
 
 
308 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  33.45 
 
 
308 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  30.6 
 
 
319 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2032  chemotaxis protein CheV  33.9 
 
 
338 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00977151  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02869  hypothetical protein  31.79 
 
 
313 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2462  response regulator receiver modulated CheW protein  31.15 
 
 
314 aa  159  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0985134  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  31.74 
 
 
310 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0231  chemotaxis protein CheV  33 
 
 
313 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  30.42 
 
 
324 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  32.69 
 
 
309 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1343  response regulator receiver modulated CheW protein  34.35 
 
 
306 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.447173  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2344  response regulator receiver modulated CheW protein  31.15 
 
 
314 aa  158  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.088498  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01327  chemotaxis protein CheV  31.97 
 
 
319 aa  158  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.750704  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  31.89 
 
 
316 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2319  putative CheW protein  30.48 
 
 
314 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00776156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 
325 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2594  putative CheW protein  30.16 
 
 
314 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0125388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2708  response regulator receiver modulated CheW protein  30.16 
 
 
314 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.404736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1752  response regulator receiver modulated CheW protein  30.16 
 
 
314 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0141626  hitchhiker  0.0048436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2633  putative CheW protein  30.16 
 
 
314 aa  156  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0317026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  33.01 
 
 
309 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  34.43 
 
 
312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  32.99 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1944  response regulator receiver modulated CheW protein  30.77 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000211383  normal  0.0128896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  33.01 
 
 
309 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1595  response regulator receiver modulated CheW protein  32.65 
 
 
307 aa  155  6e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003013  chemotaxis protein CheV  29.9 
 
 
317 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  33.33 
 
 
306 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
306 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  34.09 
 
 
312 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  33.01 
 
 
309 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  33.33 
 
 
306 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  28.8 
 
 
326 aa  155  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  33.55 
 
 
326 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  33.12 
 
 
320 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  33.33 
 
 
306 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  35.31 
 
 
318 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  35.03 
 
 
306 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.262439  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3089  response regulator receiver modulated CheW protein  34.01 
 
 
306 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2144  response regulator receiver modulated CheW protein  31.99 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000067765  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  33.97 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 
306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  32.65 
 
 
306 aa  153  4e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  32.99 
 
 
306 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  29.77 
 
 
322 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  28.99 
 
 
326 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  30.62 
 
 
326 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  31.76 
 
 
322 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2144  CheW-like protein  30.77 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00213305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2678  response regulator receiver modulated CheW protein  30.61 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0199239  normal  0.361965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  33.22 
 
 
309 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  31.72 
 
 
309 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  32.26 
 
 
310 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  31.27 
 
 
342 aa  151  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  28.34 
 
 
326 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  30.38 
 
 
308 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  30.38 
 
 
308 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  28.34 
 
 
326 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  28.34 
 
 
326 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2316  response regulator receiver modulated CheW protein  30.23 
 
 
313 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90141  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  31.03 
 
 
320 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  28.34 
 
 
326 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  32.65 
 
 
306 aa  150  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  29.55 
 
 
311 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  30.84 
 
 
310 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2320  chemotaxis protein CheV  32.19 
 
 
306 aa  149  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.698234  normal  0.255434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2852  putative CheW protein  34.07 
 
 
310 aa  149  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.141391 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  32.88 
 
 
306 aa  149  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  31.4 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  32.19 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>