More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3068 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3068  CheW protein  100 
 
 		 315 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.591629  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2021  response regulator receiver modulated CheW protein  44.23 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2905  putative CheW protein  43.77 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0391  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  43.08 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1997  putative CheW protein  42.54 
 
 		 320 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.151796  normal  0.289179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2084  response regulator receiver modulated CheW protein  41.74 
 
 		 336 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.364681  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2939  response regulator receiver modulated CheW protein  41.07 
 
 		 323 aa  248  9e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1493  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  41.48 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000176679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2308  putative CheW protein  42.5 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0147  response regulator receiver modulated CheW protein  39.87 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0197  response regulator receiver modulated CheW protein  36.54 
 
 		 346 aa  219  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3100  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  39.1 
 
 		 312 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2643  response regulator receiver modulated CheW protein  35.66 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1179  response regulator receiver modulated CheW protein  36.31 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3194  putative CheW protein  36.31 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3188  putative CheW protein  36.31 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3332  putative CheW protein  36.31 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2739  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  37.01 
 
 		 312 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2798  putative CheW protein  36.13 
 
 		 326 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0508  putative CheW protein  36.86 
 
 		 326 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4442  response regulator receiver modulated CheW protein  35.85 
 
 		 324 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05890  hypothetical protein  35.05 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1207  chemotaxis protein CheV  34.08 
 
 		 328 aa  189  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0176167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  36.66 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000281  chemotaxis protein CheV  33.76 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.261322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1284  putative CheW protein  34.49 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0879  chemotaxis protein CheV  35.06 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.877082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2548  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000602434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1583  response regulator receiver modulated CheW protein  33.77 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000416178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0066  response regulator receiver modulated CheW protein  35.13 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000119617  hitchhiker  0.00287896 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0724  response regulator receiver modulated CheW protein  32.28 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.95273e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2843  response regulator receiver modulated CheW protein  34.5 
 
 		 302 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0712  response regulator receiver modulated CheW protein  32.28 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1573  response regulator receiver modulated CheW protein  34.2 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204601  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1369  putative CheW protein  34.85 
 
 		 302 aa  155  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000715462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2045  chemotaxis signal transduction protein, CheV-like  32.69 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.85794e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1723  chemotaxis protein CheV  33.88 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3623  chemotaxis protein CheV  33.88 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1754  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1544  chemotaxis protein  33.55 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0242489  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1533  chemotaxis protein  33.55 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1832  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000391967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  30.98 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1777  chemotaxis protein CheV  33.55 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.782238  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3225  response regulator receiver modulated CheW protein  33.97 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185014  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0734  response regulator receiver:CheW-like protein  32.99 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2470  response regulator receiver modulated CheW protein  30.89 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0196  response regulator receiver modulated CheW protein  29.24 
 
 		 346 aa  139  3.9999999999999997e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.031176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3224  response regulator receiver modulated CheW protein  34.08 
 
 		 319 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0522  putative CheW protein  33.33 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2613  response regulator receiver modulated CheW protein  29.61 
 
 		 325 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0924  response regulator receiver modulated CheW protein  28.62 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3734  response regulator receiver modulated CheW protein  30.94 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3954  response regulator receiver modulated CheW protein  30.72 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1461  putative CheW protein  30.72 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1476  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheW protein  33.11 
 
 		 324 aa  135  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0204  CheW domain protein  27.55 
 
 		 316 aa  135  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000487468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4393  chemotaxis protein CheV  30.39 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1176  putative CheW protein  30.58 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.531119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4985  response regulator receiver:CheW-like protein  30.16 
 
 		 318 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4253  CheW protein  30.29 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5616  response regulator receiver modulated CheW protein  29.97 
 
 		 316 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.375026 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1656  ATP synthase gamma chain (ATP synthase F1 sector gammasubunit)  27.73 
 
 		 317 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.184709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3252  chemotaxis protein CheV  31.92 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0735  response regulator receiver:CheW-like protein  32.57 
 
 		 311 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3501  response regulator receiver modulated CheW protein  27.78 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.598076 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1431  response regulator receiver modulated CheW protein  33.44 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4573  response regulator receiver modulated CheW protein  27.78 
 
 		 316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.639433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1838  response regulator receiver modulated CheW protein  28.03 
 
 		 321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.230108  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1579  chemotaxis protein CheV  28.12 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.184882  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03881  putative response regulator transcription regulator protein  27.78 
 
 		 313 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521949  normal  0.59764 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1338  response regulator receiver modulated CheW protein  31.92 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1449  response regulator receiver modulated CheW protein  27.65 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  33.11 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3018  CheW protein  28.76 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84949 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1424  response regulator receiver modulated CheW protein  29.14 
 
 		 325 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1301  CheW-like protein  31.6 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1805  response regulator receiver modulated CheW protein  32.78 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.123386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1327  response regulator receiver modulated CheW protein  31.27 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1319  response regulator receiver modulated CheW protein  31.27 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0920942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1257  response regulator receiver modulated CheW protein  31.27 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1068  putative CheW protein  30.32 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0334866  normal  0.0302452 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2949  putative CheW protein  30.94 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1414  response regulator receiver modulated CheW protein  30.94 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3102  response regulator receiver modulated CheW protein  30.94 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.896505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1159  response regulator receiver modulated CheW protein  31.27 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.601808  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2964  putative CheW protein  30.94 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.725917  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4933  putative response regulator receiver (CheY-like) involved in chemotaxis  29.9 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173403  normal  0.920687 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2599  putative CheW protein  30.62 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1781  putative chemotaxis protein  31.7 
 
 		 310 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20750  putative chemotaxis protein  31.29 
 
 		 310 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3486  response regulator receiver:CheW-like protein  30 
 
 		 308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0311  chemotaxis protein CheV  27.53 
 
 		 318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0333  chemotaxis protein CheV  27.53 
 
 		 318 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1927  chemotaxis protein CheV, putative  29.68 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.203525  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1686  chemotaxis protein CheV  27.53 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.468174  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1763  putative CheW protein  30.07 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3759  response regulator receiver modulated CheW protein  29.84 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00050568  normal  0.01011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0330  chemotaxis protein CheV  26.73 
 
 		 318 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2450  CheW protein  26.97 
 
 		 333 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.979041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>