More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0908 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0908  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
127 aa  251  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.547384 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0790  cold-shock DNA-binding protein family protein  95.24 
 
 
127 aa  239  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04160  cold-shock DNA-binding protein family  53.97 
 
 
127 aa  148  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0300603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31390  cold-shock DNA-binding protein family  53.97 
 
 
127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.5492  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3580  putative cold-shock DNA-binding domain protein  53.97 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0321058  normal  0.113438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0746  cold-shock DNA-binding domain protein  54.76 
 
 
127 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0633058  hitchhiker  0.00940381 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0234  cold-shock DNA-binding protein family protein  52.76 
 
 
127 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8902  putative cold-shock DNA-binding domain protein  53.44 
 
 
132 aa  140  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197613  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0104  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.59 
 
 
129 aa  140  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0818  cold-shock DNA-binding domain protein  52.31 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0848  cold-shock DNA-binding domain protein  50.79 
 
 
127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  decreased coverage  0.00674689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2930  cold-shock DNA-binding domain protein  52.38 
 
 
127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.915487  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0722  cold-shock DNA-binding domain protein  50.39 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.155583 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0007  cold shock protein  47.24 
 
 
129 aa  136  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34040  cold-shock DNA-binding protein family  50.39 
 
 
128 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4185  cold-shock DNA-binding domain protein  50.79 
 
 
127 aa  134  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.942545  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24110  cold-shock DNA-binding protein family  49.23 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0146  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.38 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  46.92 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3947  cold-shock protein, DNA-binding  47.66 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.986356  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4338  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.66 
 
 
128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0481  cold-shock DNA-binding domain protein  48.03 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8097  cold-shock DNA-binding domain protein  46.92 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26200  cold-shock DNA-binding protein family  48.82 
 
 
128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2047  cold-shock DNA-binding domain protein  47.62 
 
 
127 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4426  cold-shock DNA-binding protein family protein  50.38 
 
 
131 aa  126  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.285968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1236  Cold-shock protein DNA-binding protein  49.26 
 
 
155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10888  cold shock protein B cspB  46.27 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73128e-16  normal  0.272066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3932  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.38 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558986  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5045  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.93 
 
 
136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4562  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.67 
 
 
136 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0340056 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4858  cold-shock DNA-binding protein family protein  46.67 
 
 
136 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705438  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0825  cold-shock DNA-binding domain protein  45.65 
 
 
139 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.425934  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1707  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.19 
 
 
136 aa  122  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4475  cold-shock DNA-binding protein family protein  45.93 
 
 
147 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3294  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.09 
 
 
131 aa  117  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977708  normal  0.173304 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4731  cold-shock DNA-binding domain protein  49.22 
 
 
129 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5860  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 
144 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.03 
 
 
66 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0312  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
418 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.147611  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.94 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  49.25 
 
 
67 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.62 
 
 
65 aa  60.5  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
65 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2338  cold-shock DNA-binding domain protein  41.54 
 
 
143 aa  59.3  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00428193  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  45 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.88 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.62 
 
 
65 aa  58.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  42.42 
 
 
66 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0928  cold-shock DNA-binding domain protein  49.12 
 
 
65 aa  57.8  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3185  cold-shock protein, DNA-binding  40 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.937654  normal  0.149852 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 
65 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.27 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  42.42 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  43.75 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  43.75 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  44.83 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  44.83 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  44.83 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  44.83 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.28 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  44.83 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  44.83 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  40.91 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.75 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.79 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.83 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1911  cold-shock DNA-binding protein family protein  53.57 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000206161  normal  0.143594 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  45.31 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.44 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  44.83 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  43.33 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  43.08 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  49.18 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  46.27 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.62 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  42.86 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  43.75 
 
 
69 aa  55.5  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  37.88 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  46.67 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1111  cold shock transcriptional regulator CspA  46.15 
 
 
70 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0754  cold-shock DNA-binding domain protein  40.98 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  45.45 
 
 
68 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.28 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.28 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  43.28 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  42.42 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  43.28 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>