More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_04160 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_04160  cold-shock DNA-binding protein family  100 
 
 		 127 aa  258  3e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0300603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0848  cold-shock DNA-binding domain protein  60.63 
 
 		 127 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.433224  decreased coverage  0.00674689 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31390  cold-shock DNA-binding protein family  58.27 
 
 		 127 aa  156  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.5492  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0790  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.91 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0104  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.52 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0746  cold-shock DNA-binding domain protein  59.84 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0633058  hitchhiker  0.00940381 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0908  cold-shock DNA-binding domain protein  53.97 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.547384 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0234  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.35 
 
 		 127 aa  147  4e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26200  cold-shock DNA-binding protein family  57.81 
 
 		 128 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109676  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0007  cold shock protein  51.59 
 
 		 129 aa  143  9e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2047  cold-shock DNA-binding domain protein  55.12 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.716085 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0722  cold-shock DNA-binding domain protein  52.38 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.155583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4185  cold-shock DNA-binding domain protein  56.69 
 
 		 127 aa  142  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.942545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2930  cold-shock DNA-binding domain protein  53.54 
 
 		 127 aa  140  7e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.915487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0818  cold-shock DNA-binding domain protein  55.38 
 
 		 135 aa  140  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24110  cold-shock DNA-binding protein family  53.79 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3580  putative cold-shock DNA-binding domain protein  55.12 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0321058  normal  0.113438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8902  putative cold-shock DNA-binding domain protein  51.15 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0481  cold-shock DNA-binding domain protein  54.33 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0812  cold-shock DNA-binding domain protein  52.31 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4338  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.97 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4731  cold-shock DNA-binding domain protein  56.59 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8097  cold-shock DNA-binding domain protein  50.76 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34040  cold-shock DNA-binding protein family  52.76 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3947  cold-shock protein, DNA-binding  51.18 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.986356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1707  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5045  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.26 
 
 		 136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3932  cold-shock DNA-binding protein family protein  49.23 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.558986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4426  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.54 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.285968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0146  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  49.62 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0825  cold-shock DNA-binding domain protein  47.14 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.425934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4562  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.79 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1236  Cold-shock protein DNA-binding protein  48.53 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4858  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.79 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705438  normal  0.0994336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10888  cold shock protein B cspB  46.67 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.73128e-16  normal  0.272066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4475  cold-shock DNA-binding protein family protein  47.06 
 
 		 147 aa  120  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.534449  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3294  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50.38 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.977708  normal  0.173304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5860  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.344345 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0200  cold-shock DNA-binding domain protein  49.21 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0333811  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0312  cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 		 418 aa  55.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.147611  hitchhiker  0.000223606 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  41.67 
 
 		 310 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  42.19 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3621  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0652324  hitchhiker  0.000182164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0638  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.557859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3383  cold-shock DNA-binding domain protein  34.85 
 
 		 198 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.706051  normal  0.504445 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08241  cold-shock DNA-binding domain protein  40.58 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0769  cold-shock DNA-binding domain protein  44.12 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.218929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  38.46 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.138203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2754  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.42 
 
 		 69 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  41.27 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  39.68 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  39.68 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.19 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0942  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.62 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1475  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04410  cold shock domain protein CspD  47.54 
 
 		 317 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  44.78 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  40.62 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001460  cold shock protein CspE  40.62 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 66 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  41.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0144  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.45 
 
 		 259 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.569824  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  41.67 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1465  cold-shock DNA-binding domain protein  37.88 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000499386  normal  0.887495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3065  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000279167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1750  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0957427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  39.71 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 69 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  42.86 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  43.94 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  41.27 
 
 		 66 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  41.54 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  36.76 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  39.68 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3200  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 		 279 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.693924  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1247  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.42 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3156  cold-shock DNA-binding domain protein  46.88 
 
 		 268 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2974  cold-shock protein DNA-binding  46.88 
 
 		 281 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.372989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  40.62 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  40 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.62 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  40.62 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>