More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0754 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0754  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
66 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
65 aa  100  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
65 aa  93.2  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
65 aa  93.2  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
65 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
65 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
65 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
66 aa  92  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  66.15 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.12 
 
 
66 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
66 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  69.84 
 
 
66 aa  90.5  8e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  64.62 
 
 
65 aa  90.1  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
67 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 
68 aa  89.7  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4749  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 
65 aa  89.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000498779  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
67 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  66.67 
 
 
68 aa  89.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.06 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 
68 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 
65 aa  89.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
67 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  63.49 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  62.5 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  64.06 
 
 
77 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  66.67 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
65 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
66 aa  87.4  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
65 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 
66 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.46 
 
 
67 aa  87  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 
67 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.58 
 
 
66 aa  87  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 
67 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 
67 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  64.62 
 
 
65 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 
83 aa  87  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  64.62 
 
 
65 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  64.62 
 
 
65 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
65 aa  87  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
67 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.94 
 
 
92 aa  87  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  63.49 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  64.62 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  64.62 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  67.74 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2627  cold-shock DNA-binding domain protein  61.9 
 
 
66 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
66 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 
66 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  64.62 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  62.5 
 
 
66 aa  85.9  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 
66 aa  86.7  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.92 
 
 
65 aa  85.9  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  63.49 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.25 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1878  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  66.13 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3308  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  66.13 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>