More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0945 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 66 aa  138  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 66 aa  138  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 65 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.73 
 
 		 66 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 66 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.18 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 65 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.46 
 
 		 65 aa  93.6  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  63.08 
 
 		 66 aa  93.6  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  73.02 
 
 		 68 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  60.94 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0754  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  68.85 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  68.85 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.85 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.21 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.21 
 
 		 65 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.93 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.25 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  57.81 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 		 68 aa  88.2  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 65 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  60.66 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  65.57 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.57 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 		 66 aa  87.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  66.13 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.29 
 
 		 65 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 		 65 aa  87.4  6e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 		 68 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 		 66 aa  87  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1938  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 66 aa  87  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199562  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 68 aa  87  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  60 
 
 		 67 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 67 aa  86.7  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 		 67 aa  86.7  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  58.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  58.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 65 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.06 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  62.9 
 
 		 66 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 		 65 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  58.06 
 
 		 67 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.52 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.29 
 
 		 65 aa  85.5  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.54 
 
 		 67 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.29 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 		 65 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0555  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 		 66 aa  85.9  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705321  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  62.5 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  63.93 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  55.38 
 
 		 67 aa  85.5  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  56.25 
 
 		 67 aa  85.1  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.38 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  63.33 
 
 		 66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>