More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1878 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1878  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
66 aa  134  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 
66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  73.85 
 
 
66 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
66 aa  100  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 
66 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
65 aa  99.8  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  72.31 
 
 
66 aa  99  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  98.6  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 
66 aa  98.6  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0208  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000807689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  69.23 
 
 
66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  68.18 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0191  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
66 aa  94.7  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  8.97537e-36 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  67.69 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  69.84 
 
 
67 aa  93.6  8e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4356  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.184389 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  66.15 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 
66 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
68 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0979  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 
65 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1110  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 
69 aa  91.3  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0603017  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  64.62 
 
 
66 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
66 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
66 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 
65 aa  90.5  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.62 
 
 
66 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_008009  Acid345_4183  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.5 
 
 
67 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0862888  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
66 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1938  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
66 aa  90.1  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.199562  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
67 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
66 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2891  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 
66 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.87323e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0191  cold-shock domain-contain protein  61.54 
 
 
66 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  63.08 
 
 
66 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 
67 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
67 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 
65 aa  89.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  67.74 
 
 
67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4519  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.5 
 
 
66 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0985  cold-shock domain-contain protein  62.9 
 
 
165 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.693181  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  63.49 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  63.49 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
67 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  64.62 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2863  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0890  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 
67 aa  88.6  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000324148  normal  0.0824036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0769  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
71 aa  87.8  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056179  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.08 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1391  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000857842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
65 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  63.49 
 
 
65 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
65 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>