More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5298 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  100 
 
 
67 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  100 
 
 
67 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  98.51 
 
 
67 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  98.46 
 
 
65 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  98.46 
 
 
65 aa  130  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  98.46 
 
 
65 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  90.77 
 
 
65 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  80 
 
 
65 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  81.54 
 
 
65 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  85.94 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.94 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.81 
 
 
65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  83.08 
 
 
65 aa  111  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  83.08 
 
 
65 aa  111  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  83.08 
 
 
65 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  110  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  76.92 
 
 
65 aa  110  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  84.38 
 
 
66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  81.54 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  81.54 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  81.54 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.95 
 
 
66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  81.54 
 
 
65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  81.54 
 
 
65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  84.38 
 
 
66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  81.54 
 
 
65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  84.38 
 
 
66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  80 
 
 
65 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  80 
 
 
65 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  82.81 
 
 
77 aa  107  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
65 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  80.33 
 
 
66 aa  105  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  80.65 
 
 
66 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.03 
 
 
66 aa  104  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  71.64 
 
 
67 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  71.64 
 
 
67 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  79.03 
 
 
66 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
68 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
65 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
83 aa  103  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
67 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 
66 aa  101  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 
66 aa  100  5e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 
66 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 
66 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
66 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 
66 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 
66 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  76.19 
 
 
66 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.19 
 
 
66 aa  98.6  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  70.77 
 
 
66 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 
66 aa  98.2  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 
66 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  70.15 
 
 
67 aa  97.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  97.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 
65 aa  97.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2370  cold shock proteins  70.31 
 
 
66 aa  97.1  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.71289e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.35 
 
 
66 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
65 aa  96.7  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  74.19 
 
 
66 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 
67 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 
66 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 
67 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  68.66 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  68.66 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  68.66 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  70.15 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  68.66 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  68.66 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.19 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  69.7 
 
 
70 aa  94.7  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  69.7 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  69.7 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>