More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2017 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
65 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  81.25 
 
 
92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  82.81 
 
 
67 aa  111  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 
68 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 
67 aa  105  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  78.46 
 
 
67 aa  105  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.92 
 
 
67 aa  104  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 
67 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 
66 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 
66 aa  103  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  77.27 
 
 
68 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
66 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  73.44 
 
 
67 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
67 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  75.38 
 
 
67 aa  100  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
67 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 
67 aa  99.4  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  75.38 
 
 
67 aa  99  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
67 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
67 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  73.44 
 
 
67 aa  99  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 
67 aa  99  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 
67 aa  99  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 
66 aa  99  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
67 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 
67 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 
67 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
67 aa  98.2  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.38 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 
67 aa  97.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 
68 aa  97.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 
67 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 
69 aa  97.1  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  76.56 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
94 aa  96.7  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
65 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 
67 aa  96.7  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  70.97 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  70.97 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  72.31 
 
 
67 aa  96.7  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 
65 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  70.97 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  72.13 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  67.69 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.58 
 
 
65 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  67.69 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  69.35 
 
 
62 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 
65 aa  95.9  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1731  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 
69 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.0000000915529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.33 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
67 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
67 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 
67 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 
67 aa  94.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
70 aa  94.7  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.44614  hitchhiker  0.00284754 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  71.67 
 
 
66 aa  94.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  66.15 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  66.15 
 
 
65 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  71.67 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  72.58 
 
 
67 aa  94  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  66.15 
 
 
65 aa  94  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
67 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  67.69 
 
 
67 aa  94  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 
65 aa  94  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>