More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3245 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 65 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.25 
 
 		 66 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  78.46 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.81 
 
 		 66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  78.46 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  82.81 
 
 		 66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  80 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  80 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 65 aa  108  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  76.92 
 
 		 65 aa  107  6e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  81.25 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  76.92 
 
 		 65 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  76.92 
 
 		 65 aa  107  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  78.46 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  78.46 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  78.46 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  78.46 
 
 		 65 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  78.46 
 
 		 65 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  78.46 
 
 		 65 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  78.46 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  76.92 
 
 		 65 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  76.92 
 
 		 65 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  76.92 
 
 		 65 aa  106  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 65 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  75.38 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  75.38 
 
 		 65 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 		 65 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.38 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  79.03 
 
 		 66 aa  103  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.56 
 
 		 66 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  76.56 
 
 		 66 aa  103  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  73.85 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  73.85 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 		 66 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.03 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  76.56 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.78 
 
 		 66 aa  100  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 66 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  77.42 
 
 		 66 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.31 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 66 aa  98.6  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.85 
 
 		 66 aa  98.6  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4529  cold shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 68 aa  98.6  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  74.19 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1881  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 69 aa  98.6  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0395263  normal  0.068791 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  69.23 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  72.13 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 		 66 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0755  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 68 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 65 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  69.23 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  77.05 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1057  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 68 aa  97.1  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2158  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1543  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 68 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3784  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 69 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.19 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.74 
 
 		 65 aa  96.7  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 92 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  67.69 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>