More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1440 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1440  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 67 aa  138  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0493  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  83.33 
 
 		 66 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.156279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  64.18 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  61.19 
 
 		 67 aa  95.1  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  93.2  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5001  cold shock protein  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.56924e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2822  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000720852  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2474  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00166025  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  61.54 
 
 		 69 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01793  stress protein, member of the CspA-family  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000145825  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1820  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000376643  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1981  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000173649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2051  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2089  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.57783e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1478  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000112944  normal  0.636634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2393  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000101532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1920  cold shock-like protein CspC  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000217103  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1913  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000658  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2213  cold shock-like protein CspC  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00000972653  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2038  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000133144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1365  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000234098  normal  0.0150165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1977  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000786929  normal  0.190727 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 		 67 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1294  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000632959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2554  cold shock-like protein CspC  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000000810099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01781  hypothetical protein  61.54 
 
 		 69 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000220518  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1977  cold shock-like protein CspC  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  58.21 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  62.9 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2027  cold shock-like protein CspC  60 
 
 		 69 aa  92  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.21 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  56.72 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2958  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  90.9  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0282333  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  91.3  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  55.22 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1668  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.46 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000281076  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0261  cold shock protein CspE  60 
 
 		 69 aa  90.5  7e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  90.1  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 68 aa  90.1  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00070927  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0368  cold-shock DNA-binding domain protein  59.38 
 
 		 68 aa  89.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  2.16983e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2503  cold-shock DNA-binding protein family protein  55.22 
 
 		 68 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000079429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  60.94 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0290  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  55.22 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  52.24 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.72 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.22 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  58.46 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  59.38 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  59.09 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  59.09 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  56.72 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  55.22 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3333  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.81 
 
 		 70 aa  88.2  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  53.73 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.46 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0751  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.46 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3733  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.29 
 
 		 68 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.613597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  58.21 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.7 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>