More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2178 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 65 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  75.38 
 
 		 65 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  72.31 
 
 		 67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  72.31 
 
 		 67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 67 aa  105  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 67 aa  105  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  70.77 
 
 		 67 aa  105  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  70.77 
 
 		 67 aa  105  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 67 aa  105  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  70.77 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 65 aa  105  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 65 aa  104  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.85 
 
 		 65 aa  103  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 66 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 		 67 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 		 66 aa  101  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  72.31 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  72.31 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  72.31 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.81 
 
 		 66 aa  100  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  72.31 
 
 		 65 aa  100  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  72.31 
 
 		 65 aa  100  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  72.31 
 
 		 65 aa  100  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 65 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 65 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 67 aa  99.4  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  70.31 
 
 		 77 aa  99  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 83 aa  99  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  70.77 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  68.75 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 66 aa  97.8  5e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 65 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  72.58 
 
 		 66 aa  97.1  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 66 aa  95.9  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65.08 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.25 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1523  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.31 
 
 		 66 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.478782  normal  0.638647 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.58 
 
 		 65 aa  95.5  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  65.62 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 66 aa  94.7  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  66.67 
 
 		 66 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  65.62 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 65 aa  93.2  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  64.06 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  69.35 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  61.54 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.9 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60 
 
 		 67 aa  91.3  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.67 
 
 		 66 aa  90.5  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  65.57 
 
 		 66 aa  90.5  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.9 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 66 aa  89.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  70 
 
 		 66 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.9 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  64.62 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>