More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0392 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  100 
 
 
92 aa  192  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  84.62 
 
 
66 aa  120  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 
67 aa  117  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  75.76 
 
 
66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  81.25 
 
 
65 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  80 
 
 
68 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  74.24 
 
 
66 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.61 
 
 
67 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  77.61 
 
 
67 aa  110  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 
66 aa  110  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  78.46 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
67 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  76.12 
 
 
67 aa  106  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  78.46 
 
 
68 aa  106  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
66 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.63 
 
 
67 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.64 
 
 
67 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.33 
 
 
94 aa  102  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  73.13 
 
 
67 aa  102  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  68.66 
 
 
67 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  70.15 
 
 
67 aa  101  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  100  8e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  100  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  99.8  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
68 aa  99.8  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  67.16 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  98.6  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  70.15 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 
67 aa  97.1  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 
67 aa  96.7  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
65 aa  96.3  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 
67 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  68.18 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 
67 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  64.18 
 
 
77 aa  94.4  5e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0013  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  94  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  66.18 
 
 
69 aa  94  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  94  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26130  cold-shock DNA-binding protein family  69.7 
 
 
67 aa  93.6  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5929  putative cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 
67 aa  93.6  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.380899  normal  0.0156128 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2279  cold-shock DNA-binding domain protein  69.12 
 
 
310 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.703886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13677  cold shock protein A cspA  68.66 
 
 
67 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0108357  normal  0.108106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02500  cold-shock DNA-binding protein family  66.13 
 
 
62 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169268  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5398  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
67 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.262283  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2202  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.65 
 
 
69 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.532688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4077  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  92  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1392  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.23 
 
 
67 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.329269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 
67 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 
66 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  65.62 
 
 
66 aa  92  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  92  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
66 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.33 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
65 aa  92  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 
66 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0587  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  92  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  62.5 
 
 
65 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1040  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.366618  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.38 
 
 
66 aa  91.7  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.21 
 
 
66 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2333  cold-shock DNA-binding domain protein  71.88 
 
 
67 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000675435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  68.85 
 
 
66 aa  91.3  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2600  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.88 
 
 
67 aa  91.7  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612278  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  67.19 
 
 
65 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
65 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.23 
 
 
67 aa  90.9  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 
83 aa  90.5  6e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
66 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 
69 aa  90.9  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0410712 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3098  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.89 
 
 
69 aa  90.5  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208356  normal  0.0206903 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0220  cold-shock DNA-binding domain protein  65.15 
 
 
67 aa  90.5  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.33 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 
65 aa  90.5  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  63.08 
 
 
66 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 
67 aa  90.5  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3828  cold-shock DNA-binding protein family protein  54.22 
 
 
86 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>