More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0982 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 83 aa  170  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  70.15 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  70.15 
 
 		 67 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  71.88 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  71.88 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  75 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  71.88 
 
 		 65 aa  100  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 		 65 aa  100  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 65 aa  100  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 		 66 aa  100  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.44 
 
 		 65 aa  100  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0387  cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000327706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  74.19 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  71.43 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.84 
 
 		 66 aa  99.8  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 65 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 65 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  76.19 
 
 		 66 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  73.02 
 
 		 65 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1172  cold shock protein CspE  68.12 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3159  cold shock protein CspE  68.12 
 
 		 69 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  72.31 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  98.2  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  67.61 
 
 		 77 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  75.81 
 
 		 66 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 		 65 aa  97.8  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0684  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0744  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.231158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0730  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0788  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0838453  normal  0.873226 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 66 aa  97.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1159  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.752683 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0670  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00211319  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  67.69 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.97 
 
 		 67 aa  97.4  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0644  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000253244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  71.21 
 
 		 69 aa  97.4  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1083  cold-shock DNA-binding domain protein  71.21 
 
 		 69 aa  97.1  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 66 aa  97.1  8e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.19 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.13 
 
 		 66 aa  96.7  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00593  cold shock protein E  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3002  cold-shock DNA-binding domain protein  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0538  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0320  cold-shock DNA-binding protein family  75.81 
 
 		 68 aa  96.3  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.673011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 		 65 aa  96.3  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0712  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0018015  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  70.97 
 
 		 66 aa  95.9  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0648  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00594526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00582  hypothetical protein  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.287726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  72.58 
 
 		 85 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.6 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0644  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0784428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3021  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0130834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.31 
 
 		 67 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0675  cold shock protein CspE  69.57 
 
 		 69 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000392249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  75.81 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  73.02 
 
 		 66 aa  96.7  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  69.7 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 65 aa  95.9  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  64.29 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  64.29 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.85 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  64.29 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  64.29 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  69.7 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  73.02 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.43 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  64.29 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  64.29 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  65.08 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  69.7 
 
 		 69 aa  94.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.02 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>