More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0880 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0880  cold shock protein  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000035682  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  89.39 
 
 		 66 aa  122  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0756  cold-shock DNA-binding protein family protein  80.3 
 
 		 66 aa  110  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000688666  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  80 
 
 		 65 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1376  cold-shock DNA-binding protein family protein  72.73 
 
 		 67 aa  102  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.7 
 
 		 66 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  69.84 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  65.08 
 
 		 83 aa  95.1  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1878  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 66 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  70.31 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  67.69 
 
 		 66 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  94.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 66 aa  95.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 66 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3141  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0244532  hitchhiker  0.00153434 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  67.74 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  67.74 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.74 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  67.74 
 
 		 65 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05396  hypothetical protein  68.25 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  67.74 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.35 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  63.08 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  64.62 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0028  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.3 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000670362  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0387  cold-shock DNA-binding domain protein  59.68 
 
 		 67 aa  91.3  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000327706  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3392  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.66 
 
 		 68 aa  90.9  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0278  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 		 65 aa  90.9  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 65 aa  90.9  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  66.67 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 65 aa  90.5  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.19 
 
 		 67 aa  90.1  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 65 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.73 
 
 		 66 aa  90.1  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.32 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2791  cold-shock domain-contain protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.827238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3609  cold shock transcription regulator protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0979  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.327909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2936  cold-shock domain-contain protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3184  cold-shock domain-contain protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3622  cold-shock domain-contain protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  61.67 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.32 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3598  CspE-related protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  62.12 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1750  cold-shock domain-contain protein  68.75 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.54 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  57.58 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1092  cold shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 		 69 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000741991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.9 
 
 		 65 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0301  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  88.2  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00253542  normal  0.0688177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.61 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1655  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.85 
 
 		 69 aa  88.2  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.260165  normal  0.588405 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  61.54 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0923  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 		 66 aa  87.8  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000200134  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2965  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 68 aa  87.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000138264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1374  cold-shock DNA-binding domain protein  67.16 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.287556  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  66.13 
 
 		 67 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>