More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4749 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4749  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 
65 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000498779  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  72.58 
 
 
65 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  69.35 
 
 
65 aa  93.6  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 
65 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  68.85 
 
 
66 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  66.13 
 
 
65 aa  89.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0581  cold-shock domain-contain protein  68.33 
 
 
66 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0754  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 
66 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2739  cold-shock DNA-binding domain protein  62.3 
 
 
68 aa  88.6  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000080188  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1502  cold-shock DNA-binding domain protein  62.3 
 
 
68 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.683183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  68.33 
 
 
66 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  68.33 
 
 
66 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  65 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1266  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.3 
 
 
66 aa  87.8  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.7573e-18  decreased coverage  0.00000000000100442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.33 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
67 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 
65 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  68.33 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3711  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000509741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.93 
 
 
67 aa  87.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  65 
 
 
66 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.9 
 
 
65 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65 
 
 
66 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.33 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.13 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.52 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3185  cold-shock DNA-binding domain protein  63.33 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000997397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  64.52 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  64.52 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  64.52 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1077  cold-shock DNA-binding domain protein  63.33 
 
 
66 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27833e-32 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1905  cold shock domain-contain protein  59.68 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  63.33 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4380  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.66 
 
 
66 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0010  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 
65 aa  85.5  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000000102405  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  61.9 
 
 
66 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.49 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0387  cold-shock DNA-binding domain protein  61.67 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000327706  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  63.33 
 
 
67 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  64.52 
 
 
65 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2784  cold-shock protein DNA-binding  62.9 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2727  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.9 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  62.9 
 
 
65 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  62.3 
 
 
66 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  65 
 
 
68 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4019  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.02 
 
 
66 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000020604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  62.9 
 
 
65 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  60.32 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 
65 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  61.29 
 
 
66 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.3 
 
 
66 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.29 
 
 
66 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  61.29 
 
 
66 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0658  cold-shock DNA-binding domain protein  65 
 
 
66 aa  84  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.18008e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65 
 
 
66 aa  84.3  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.29 
 
 
65 aa  84  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.38 
 
 
72 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0958  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.33 
 
 
68 aa  84  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000177063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0645  cold-shock DNA-binding domain protein  65 
 
 
66 aa  83.6  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000155303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  61.29 
 
 
65 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  61.29 
 
 
65 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  61.29 
 
 
65 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  61.29 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.9 
 
 
67 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_007517  Gmet_0340  cold-shock DNA-binding protein family protein  60 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.6796e-20  unclonable  6.2466300000000005e-24 
 
 
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  61.29 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2005  cold-shock DNA-binding domain protein  59.02 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1727900000000003e-24 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  56.25 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  60 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 
67 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 
67 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.68 
 
 
67 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0174  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.02 
 
 
65 aa  82.8  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000215085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2222  cold-shock DNA-binding domain protein  59.02 
 
 
66 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000977172  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.9 
 
 
67 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>