More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_1327 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_1327  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 
65 aa  131  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00843058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1720  cold shock protein CspB  95.38 
 
 
65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.146917  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1474  cold shock protein  95.38 
 
 
65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1771  cold shock protein CspB  95.38 
 
 
65 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.674817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1512  cold shock protein CspB  93.85 
 
 
65 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0532666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1484  cold shock protein  93.85 
 
 
65 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00463121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1629  cold shock protein CspB  93.85 
 
 
65 aa  126  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1666  cold shock protein CspB  92.31 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3679  cold shock protein CspB  92.31 
 
 
65 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.844549  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1697  cold shock protein CspB  92.31 
 
 
65 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  86.15 
 
 
65 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
66 aa  116  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  85.94 
 
 
66 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4614  cold shock protein  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4972  cold shock protein CspD  85.48 
 
 
66 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3497  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  85.48 
 
 
66 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000616798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  83.08 
 
 
67 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  83.08 
 
 
67 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0248  cold shock protein CspD  83.87 
 
 
66 aa  110  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000599312  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5310  cold shock protein CspC  81.54 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.156889  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5040  cold shock protein CspC  81.54 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4870  cold shock protein  81.54 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4885  cold shock protein  81.54 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5647  cold shock protein CspC  81.54 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000135799 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5424  cold shock protein CspC  81.54 
 
 
65 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5280  cold shock protein CspC  81.54 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000584465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4985  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  81.54 
 
 
67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4701  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  82.26 
 
 
66 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000295831  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.92 
 
 
65 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2454  cold shock protein CspA  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2257  cold shock protein CspA  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000681816  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2216  cold shock protein  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.62754e-25  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2177  cold shock protein  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000147175  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2422  cold shock protein CspA  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000271714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2440  cold shock protein CspA  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.11145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2521  cold shock protein CspA  75.38 
 
 
67 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000175758  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  79.69 
 
 
77 aa  106  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3728  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.46 
 
 
65 aa  106  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.484525  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  77.78 
 
 
66 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2221  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  79.03 
 
 
66 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000348612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1232  cold shock protein CspA  75.38 
 
 
67 aa  104  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000325579  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  78.12 
 
 
66 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.12 
 
 
66 aa  104  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3548  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.8624399999999996e-45 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3553  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000960966  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3333  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000000736097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3297  cold shock protein  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.0310600000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3248  cold shock protein  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000222014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3594  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632893  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1777  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  103  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3557  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1670  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000143673  decreased coverage  2.4479999999999998e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3647  cold shock protein CspB  77.42 
 
 
66 aa  103  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2223  cold-shock DNA-binding protein family  73.85 
 
 
65 aa  103  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000339527  decreased coverage  1.60158e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2387  cold shock protein CspA  73.85 
 
 
67 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2944  cold shock protein CspA  73.85 
 
 
67 aa  103  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000190383  hitchhiker  0.00000000328218 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1054  cold shock protein CspA  73.85 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920965  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1029  cold shock protein  73.85 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00447e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1135  cold shock protein CspA  73.85 
 
 
67 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0226  cold-shock DNA-binding protein family protein  76.92 
 
 
65 aa  103  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017804  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  77.42 
 
 
66 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1289  cold shock protein CspA  72.31 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1035  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000461706  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1032  cold shock protein  72.31 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000608124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4154  cold shock protein CspA  72.31 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857883  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2236  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  72.31 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000182228  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1185  cold shock protein CspA  72.31 
 
 
67 aa  102  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1213  cold shock protein CspA  73.85 
 
 
67 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2963  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 
65 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0855  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.85 
 
 
67 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000708983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 
66 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3973  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 
65 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  unclonable  0.0000000000681945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2178  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.77 
 
 
65 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05490  putative cold-shock DNA-binding domain protein  74.6 
 
 
68 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.94484e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1587  cold-shock DNA-binding protein family  70.31 
 
 
66 aa  99  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000012511  unclonable  7.72165e-24 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3080  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  78.12 
 
 
65 aa  99  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3186  cold-shock DNA-binding domain protein  73.44 
 
 
67 aa  98.2  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000014796  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05400  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.43 
 
 
67 aa  97.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.33246e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0557  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 
67 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0146749  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0833  cold-shock protein DNA-binding  76.19 
 
 
66 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000457197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  76.19 
 
 
66 aa  96.7  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.31 
 
 
66 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16470  putative cold-shock DNA-binding domain protein  73.02 
 
 
67 aa  95.9  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.463030000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 
66 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1505  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.43 
 
 
66 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.248091  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  72.13 
 
 
66 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0372  cold shock protein  67.19 
 
 
66 aa  94.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.69681e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  76.19 
 
 
66 aa  94  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.74 
 
 
65 aa  94  6e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3670  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.97 
 
 
66 aa  93.6  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000254143  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  69.84 
 
 
66 aa  93.6  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2806  cold shock proteins  69.84 
 
 
85 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.72104e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1369  hypothetical protein  71.43 
 
 
66 aa  92.8  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.309276 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0982  cold-shock DNA-binding domain protein  69.84 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000734957  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>