More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3299 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3299  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 66 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8911  putative cold-shock DNA-binding domain protein  80.3 
 
 		 66 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0803  cold-shock DNA-binding domain protein  78.79 
 
 		 66 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8123  cold-shock DNA-binding domain protein  77.27 
 
 		 67 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0392  cold-shock DNA-binding protein family protein  74.24 
 
 		 92 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0310  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 67 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0268  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  75.76 
 
 		 67 aa  110  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6113  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  74.24 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0782  cold-shock DNA-binding domain protein  75.38 
 
 		 66 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.733249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6575  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  73.13 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0260  cold-shock DNA-binding protein family protein  73.13 
 
 		 67 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3637  putative cold-shock DNA-binding domain protein  71.64 
 
 		 67 aa  104  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2426  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.386206  normal  0.184038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4269  cold-shock DNA-binding protein family protein  71.64 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0218  putative cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  99  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.230692  hitchhiker  0.00399283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1580  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.507056  normal  0.495998 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4469  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0560  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1267  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.922504  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3245  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  70.49 
 
 		 65 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.370321  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10670  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  97.8  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0143  putative cold-shock DNA-binding domain protein  68.66 
 
 		 67 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0668  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.16024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2880  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 68 aa  95.5  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000807571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1775  cold-shock protein, DNA-binding  65.67 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2017  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 65 aa  95.9  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1762  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0777  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2415  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1466  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00122582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0472  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16014  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0440  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.270892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6800  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0073  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.621224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37160  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0943216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0384  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.16 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2630  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.681724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1042  cold-shock DNA-binding domain protein  64.62 
 
 		 68 aa  93.2  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3353  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0827794  hitchhiker  0.00618792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1235  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2724  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720009  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3123  cold-shock protein, DNA-binding  62.69 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0870951  normal  0.605091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5449  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.265568  normal  0.248856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02480  cold-shock DNA-binding protein family  64.18 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.181166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0036  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 66 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0103  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0892  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 68 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1463  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.302037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0948  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360484  normal  0.128926 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1492  cold-shock protein DNA-binding  66.67 
 
 		 66 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2064  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.64 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000424325  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0628  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2197  cold-shock DNA-binding domain protein  68.25 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000106738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2129  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1732  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000101176  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2532  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.62 
 
 		 65 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.19716  normal  0.287944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2869  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.77 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0181409  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0972  CSD family cold shock protein  65.08 
 
 		 77 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1817  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 66 aa  91.3  4e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0201  cold shock protein  60.61 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000435671  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  90.9  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1853  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.08 
 
 		 66 aa  90.9  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000550442  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2901  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 66 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000581473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4077  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  90.5  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0573  Cold-shock protein DNA-binding protein  64.18 
 
 		 67 aa  90.5  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C47  cold-shock DNA-binding protein family protein  63.33 
 
 		 66 aa  90.1  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3605  putative cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  89.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3242  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.5 
 
 		 66 aa  89.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2295  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.904352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4798  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4169  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  59.7 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  normal  0.740799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2342  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4884  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.71911  normal  0.101787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3880  cold-shock DNA-binding domain protein  62.69 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2334  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.213577  normal  0.0207687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5184  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427326 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0466  CSD family cold shock protein  65.08 
 
 		 66 aa  88.6  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.281351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1151  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000468526  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2100  CSD family cold shock protein  56.06 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1517  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.94 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3652  cold-shock DNA-binding domain protein  64.06 
 
 		 67 aa  88.6  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0979  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.06 
 
 		 66 aa  89  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000188175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1072  cold-shock DNA-binding domain protein  63.64 
 
 		 68 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000253624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 67 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1896  cold-shock DNA-binding domain protein  59.7 
 
 		 67 aa  89  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385975  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5019  cold shock protein CspD  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0351296  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5298  cold shock protein CspC  67.21 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4754  cold shock protein CspD  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2146  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 66 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5356  cold shock protein CspC  67.21 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4592  cold shock protein  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232551  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29050  cold-shock DNA-binding protein family  65.67 
 
 		 67 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.415515  normal  0.771728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4990  cold shock protein CspD  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00510931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1264  cold-shock DNA-binding domain protein  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000176373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5115  cold shock protein CspD  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00303936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5001  cold shock protein CspD  63.49 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.219986  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0945  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.81 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000276652  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0817  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.08 
 
 		 66 aa  88.2  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000123312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>